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Enregistrement W3174726081 · doi:10.1096/fasebj.27.1_supplement.316.4

Aberrant glycerophosphocholine metabolism is a primary and targetable pathology in Alzheimer Disease

2013· article· en· W3174726081 sur OpenAlexaff
Hongbin Xu, Leigh Anne Swayne, Katy Morin, Stephen Fai, Daniel Figeys, Steffany A. L. Bennett

Notice bibliographique

RevueThe FASEB Journal · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMetabolomics and Mass Spectrometry Studies
Établissements canadiensCarleton UniversityUniversity of VictoriaUniversity of Ottawa
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPhospholipase A2Second messenger systemEntorhinal cortexCytosolPhospholipase DArachidonic acidChemistryBiochemistryCell biologyMass spectrometry imagingBiologyIntracellularPhospholipidHippocampusEnzymeNeuroscienceMembraneMass spectrometry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Glycerophospholipids are often overlooked as immediate response elements yet they exert fundamental control over cell viability. They represent the major building blocks of biological membranes and modulate membrane trafficking. Enzymatic processing of choline‐containing membrane phospholipids by cytosolic phospholipase A2 (cPLA2) generates powerful smaller intracellular second messengers (~450–600 Da) as well as arachidonic acid and its metabolites. Individual isoforms control distinct cellular processes, but little is known about how they respond to normal brain functions and neurodegenerative disease state. Recent advances in mass spectrometry are enabling large‐scale profiling of individual lipid isoforms in brain tissue and cells. We capitalize on these advances to address the question whether aberrant membrane lipid metabolism is a risk factor for neurodegenerative disease. Here, we employed high performance liquid chromatography combined with electrospray ionization mass spectrometry (LC‐ESI‐MS) to profile glycerophosphocholine second messenger metabolism in the post‐mortem human entorhinal cortex and hippocampus, as well as in the temporal cortex and hippocampus of C57BL/6 × 129SV/J hybrid mice over the course of a 24 h period.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,224
Écart entre enseignants0,214 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2013
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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