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Enregistrement W3174912361 · doi:10.3389/fimmu.2021.714808

Underwhelming or Misunderstood? Genetic Variability of Pattern Recognition Receptors in Immune Responses and Resistance to Mycobacterium tuberculosis

2021· review· en· W3174912361 sur OpenAlexafffund
Jean-Yves Dubé, Vinicius M. Fava, Erwin Schurr, Marcel A. Behr

Notice bibliographique

RevueFrontiers in Immunology · 2021
Typereview
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueTuberculosis Research and Epidemiology
Établissements canadiensMcGill UniversityMcGill University Health Centre
Organismes subventionnairesNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesCanadian Institutes of Health ResearchNational Institutes of HealthMcGill University Health CentreMcGill University
Mots-clésImmune systemMycobacterium tuberculosisImmune recognitionPattern recognition receptorImmunologyTuberculosisBiologyMedicineComputational biologyInnate immune systemPathology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Human genetic control is thought to affect a considerable part of the outcome of infection withMycobacterium tuberculosis(Mtb). Most of us deal with the pathogen by containment (associated with clinical “latency”) or sterilization, but tragically millions each year do not. After decades of studies on host genetic susceptibility toMtbinfection, genetic variation has been discovered to play a role in tuberculous immunoreactivity and tuberculosis (TB) disease. Genes encoding pattern recognition receptors (PRRs) enable a consistent, molecularly direct interaction between humans andMtbwhich suggests the potential for co-evolution. In this review, we explore the roles ascribed to PRRs duringMtbinfection and ask whether such a longstanding and intimate interface between our immune system and this pathogen plays a critical role in determining the outcome ofMtbinfection. The scientific evidence to date suggests that PRR variation is clearly implicated in altered immunity toMtbbut has a more subtle role in limiting the pathogen and pathogenesis. In contrast to ‘effectors’ like IFN-γ, IL-12, Nitric Oxide and TNF that are critical forMtbcontrol, ‘sensors’ like PRRs are less critical for the outcome ofMtbinfection. This is potentially due to redundancy of the numerous PRRs in the innate arsenal, such thatMtbrarely goes unnoticed. Genetic association studies investigating PRRs duringMtbinfection should therefore be designed to investigate endophenotypes of infection – such as immunological or clinical variation – rather than just TB disease, if we hope to understand the molecular interface between innate immunity andMtb.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,006
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,011

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,006
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,003
Communication savante0,0020,004
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,050
Tête enseignante GPT0,336
Écart entre enseignants0,286 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations20
Publié2021
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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