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Enregistrement W3174988457 · doi:10.1096/fasebj.27.1_supplement.523.5

<i>Francisella</i> bacteria encode genes required for efficient invasion and intracellular replication in hepatocytes

2013· article· en· W3174988457 sur OpenAlexafffund
HT Law, Aarati Sriram, Charlotte Fevang, Julian A. Guttman

Notice bibliographique

RevueThe FASEB Journal · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBacillus and Francisella bacterial research
Établissements canadiensSimon Fraser University
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésFrancisella tularensisFrancisellaTularemiaIntracellularBiologyPathogenicity islandMicrobiologyGeneIntracellular parasiteComplementationBacteriaVirulenceMutantCell biologyGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Francisella tularensis is a bacterium that can cause up to 60% mortality in humans. These microbes carry a cluster of conserved genes present in all F. tularensis subspecies called the Francisella pathogenicity island (FPI). Within the FPI, iglB , iglC , pdpA and vgrG genes are important for intracellular macrophage survival and virulence; yet, their role in epithelial cell infections, a major contributor to the progression of disease, is unclear. Given that F. tularensis uses dissimilar mechanisms to enter different cell types, we hypothesized that FPI genes play a crucial role in bacterial entry into epithelial cells. To test this hypothesis, BNL CL.2 hepatocytes were infected with F. novicida for up to 48 h. Detailed microscopic examination and gentamicin protection assay revealed that Δ iglB , Δ iglC , Δ vgrG , Δ pdpA Francisella mutants were invasion and replication deficient. We showed that gene complementation restored intracellular growth. Our data suggest that IglB, IglC, PdpA and VgrG are important for hepatocyte infections, as they are vital for efficient invasion and intracellular proliferation. Grant Funding Source : NSERC, CIHR

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,019
Tête enseignante GPT0,253
Écart entre enseignants0,234 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2013
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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