Structural‐functional studies of purified transmembrane segment VI‐VII of the human isoform 1 of the Na <sup>+</sup> /H <sup>+</sup> exchanger
Notice bibliographique
Résumé
The Na + /H + exchanger isoform 1 (NHE1) is a ubiquitous pH membrane protein in mammalian cells. NHE1 regulates intracellular pH exchanging one intracellular H + for one extracellular Na + . Though the structure of membrane proteins is highly desirable, expression remains problematic. In this study we expressed and purified transmembrane (TM) VI‐VII of the NHE1 protein. A 49 kDa Maltose‐Binding‐Protein‐TMVI‐VII fusion protein was expressed in E. coli XL1 Blue cells and purified with an Amylose resin. After cleavage with Tobacco Etch Virus, free TM VI‐VII, 6.2 kDa protein was isolated and purified by reverse phase HPLC. The identity was confirmed by Mass Spectroscopy. The structure of 15 N isotopically labeled TM VI‐VII peptide was determined in dodecylphosphocholine micelles using solution‐state 2D and 3D NMR. TM VI‐VII contains a helix‐kink‐helix structure for TM VI with helices between amino acids 229–236 and 239–247. TM VII was a continuous helix from 252–274. The data suggests that the C‐terminal half of TM VI interacts with the N‐terminal half of TM VII. Future studies are further defining the helix‐helix interface between residues of TM VI and TM VII.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».