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Enregistrement W3175258892 · doi:10.1096/fasebj.26.1_supplement.1034.16

Porcine milk fat globule membrane proteins that bind to F4ac fimbria of Escherichia coli

2012· article· en· W3175258892 sur OpenAlexaffabout
Predrag Novakovic, Yanyun Huang, Chandrashekhar Charavaryamath, Betty Lockerbie, John Kelly, Matthew E. Loewen, Elemir Simko

Notice bibliographique

RevueThe FASEB Journal · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueProtein purification and stability
Établissements canadiensInstitute for Biological SciencesUniversity of SaskatchewanNational Research Council CanadaWestern University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésEnterotoxigenic Escherichia coliBiologyFimbriaBiochemistryEscherichia coliMicrobiologyEnterotoxin

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Post‐weaning colibacillosis in pigs is caused by enterotoxigenic Escherichia coli (ETEC) which is often controlled by antibiotic feed supplements with potential risk of generation of antibiotic resistant bacteria. Prevention of attachment of F4ac+ ETEC to intestinal mucosa may potentially be used as one of antibiotic‐free strategies for the control of this disease. F4ac+ ETEC has been reported to bind to fat globule membrane in porcine milk. In this study, we used two different methods to identify individual milk fat globule membrane (MFGM) proteins that interact with F4ac fimbria. First, two‐dimensional SDS‐PAGE overlay Western Blot was used to demonstrate the interaction between F4ac and several MFGM proteins: namely, lactadherin, butyrophilin, adipophilin, acyl‐CoA synthetase 3, and fatty acid binding protein 3. Subsequently, affinity chromatography was designed to isolate the following F4ac‐binding proteins from the porcine MFGM: lactadherin, butyrophilin, adipophilin, acyl‐CoA synthetase 3, fatty acid binding protein 3, and xanthine dehydrogenase. Selected individual proteins and their subunits (e.g. carbohydrates) are being tested for their inhibitory effects against attachment of ETEC to porcine enterocytes. This project was supported by the Saskatchewan Agriculture Development Fund, WCVM Canadian Vitamins Class Action Settlement Fund.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,024
Score d'incertitude au seuil0,334

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,021
Tête enseignante GPT0,257
Écart entre enseignants0,236 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2012
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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