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Enregistrement W3175404185 · doi:10.1101/2021.06.30.450538

A supergene in seaweed flies modulates male traits and female perception

2021· preprint· en· W3175404185 sur OpenAlexafffund

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2021
Typepreprint
Langueen
DomaineEarth and Planetary Sciences
ThématiqueMarine and coastal plant biology
Établissements canadiensUniversité Laval
Organismes subventionnairesFonds de Recherche du Québec - SantéFonds de recherche du Québec – Nature et technologiesHelge Ax:son Johnsons Stiftelse
Mots-clésSupergene (geology)GeneAlleleMate choiceMatingSexual selectionAdaptation (eye)Tandem exon duplicationPhenotype

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Summary Supergenes, tightly linked allelic combinations that underlie complex adaptive phenotypes represent a critical mechanism protecting intra-specific polymorphism [1, 2]. Supergenes represent some of the best examples of balancing selection in nature and there is increasing evidence that disassortative mating, when individuals preferentially mate with dissimilar phenotypes, is a key force stabilizing supergene polymorphisms. Yet, the underlying biological mechanisms and genetic basis of disassortative mating remain poorly known. Here, we examine a possible mechanism of disassortative mating driven by female mate choice in relation to the overdominant Cf-Inv(1) supergene in the seaweed fly Coelopa frigida by investigating chemical communication and its genomic architecture. We show that Cf-Inv(1) strongly affects chemical signaling; cuticular hydrocarbon (CHC) composition differed between genotypes in males but not females across two continents. In tandem, Cf-Inv(1) affected female perception of these compounds; females are able to sense 36 compounds from the male CHC cocktail but show differential perception between genotypes for almost half of them. This indicates that the genetic underpinnings of male traits and female perceptions are tightly linked within Cf-Inv(1) which likely facilitates disassortative mating [3]. A differential expression approach based on candidate genes for CHC biosynthesis and odorant detection revealed differential expression for CHC biosynthesis in males alone but broad changes in odorant receptors across both sexes. Furthermore, odorant genes clustered together within Cf-Inv(1) , with some of them differing between arrangements by 8.3% at the protein level, suggesting evolution via tandem duplication then divergence. We propose that the tight linkage between overdominant loci, male traits, and female perception has helped to maintain the Cf-Inv(1) polymorphism across its range in the face of supergene degeneration.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,189
Écart entre enseignants0,175 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2021
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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