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Enregistrement W3175469080 · doi:10.1096/fasebj.26.1_supplement.1127.8

ALTERNATIVELY SPLICED BNIP3 ISOFORM PROMOTES CELL SURVIVAL BY RECRUITING BCL‐2 TO THE IP3‐RECEPTOR

2012· article· en· W3175469080 sur OpenAlexaff
Joseph W. Gordon, Hai Yan, Hongying Gang, Lorrie A. Kirshenbaum

Notice bibliographique

RevueThe FASEB Journal · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCRISPR and Genetic Engineering
Établissements canadiensUniversity of Manitoba
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésEndoplasmic reticulumCell biologyProgrammed cell deathMutantGene isoformBiologyAlternative splicingUnfolded protein responseReceptorCellApoptosisBiochemistryGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Alternative splicing provides a versatile mechanism by which cells generate proteins with different or even antagonistic properties. We previously identified a novel splice variant of Bnip3 (Bnip3ΔEx3) generated in cardiac myocytes subjected to hypoxia. Like Full‐length Bnip3 (Bnip3FL), Bnip3ΔEx3 forms a complex with the antiapoptotic protein Bcl‐2; whereas, functional analysis of a Bnip3 mutant that lacks a Bcl‐2 interacting domain acts as a more potent inducer of programmed cell death, that can not be inhibited by Bnip3ΔEx3. In silico analysis of Bnip3ΔEx3 reveals an endoplasmic reticulum (ER) targeting domain within its C‐terminus, that is not present in Bnip3FL. We validated that Bnip3ΔEx3 is indeed localized to the ER and demonstrate that Bnip3ΔEx3 mutants that lack this ER targeting domain fail to antagonize cell death induced by Bnip3FL or hypoxia. Furthermore, we demonstrate that Bnip3ΔEx3 physically interacts with the IP3 receptor and serves to recruit Bcl‐2 to the ER; whereas, Bnip3ΔEx3 fails to protect against programmed cell death in the presence of a Bcl‐2 mutant that lacks its IP3 receptor interacting domain. Given the otherwise lethal consequences of de‐regulated Bnip3FL expression in post‐mitotic cells, our findings reveal a novel intrinsic defense mechanism that opposes the lethal consequences mitochondrial‐ER cross‐talk associated with programmed cell death in ventricular myocytes.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,289
Écart entre enseignants0,274 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2012
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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