MétaCan
Menu
← Retour à la cohorte
Enregistrement W3176478639 · doi:10.1096/fasebj.2019.33.1_supplement.449.2

Ronin (Thap11) Deficiency Results in a Disease Impacting both Vitamin B <sub>12</sub> Metabolism and Ribosome Biogenesis

2019· article· en· W3176478639 sur OpenAlexaff
Annita Achilleos, Xuefei Tong, Tiffany Chern, Matthew C. Hill, Min Zhang, Arindam Chaudhury, Joel R. Neilson, Jenny J. Sun, Russell Ray, David Watkins, David S. Rosenblatt, James F. Martin, Ross A. Poché

Notice bibliographique

RevueThe FASEB Journal · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueFolate and B Vitamins Research
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMicrocephalyGeneticsBiologyMethylmalonic acidemiaBioinformaticsEndocrinology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Combined methylmalonic acidemia and homocystinuria ( cblC type), a form of inherited intracellular vitamin B 12 deficiency, is a rare metabolic and multi‐systemic disorder caused by mutations in MMACHC . Patients with cblC can have severe neurodevelopmental defects including microcephaly, hydrocephaly and seizures as well as renal, cardiac and hematological defects. Mutations in MMACHC have been the sole known causes of cblC , until recently when an X‐linked variant of the disease was described, termed cblX . This variant was found to be due to mutations in the X‐linked gene coding for the transcription cofactor HCFC1 , which is known to be an obligatory partner for the transcription factor RONIN (THAP11). Intriguingly, a single patient exhibiting cblX‐like findings has been found to carry a mutation in RONIN . Patients, with both HCFC1 and RONIN mutations, were shown to have a dramatic reduction in MMACHC transcription. We have previously shown that the Hcfc1/Ronin transcriptional complex directly regulates mouse Mmachc expression. These findings suggest that cblX and the new Ronin (THAP11) disorder comprise a novel family of rare and severe cblC ‐like disorders that are transcriptional in nature. As a result, we have generated a mouse model that carries the human mutation in Ronin ( Ronin F80L ), in an effort to better understand the cellular mechanisms underlying the pathophysiology of these devastating neurodevelopmental diseases. Here we report the generation of the first mouse model, Ronin F80L along with its phenotypic and molecular characterization. Ronin F80L homozygous mice die soon after birth and exhibit severe brain developmental defects that recapitulate those observed in the human cblX and Ronin‐deficient patients. Moreover, consistent with a vitamin B 12 deficiency, cells from Ronin F80L homozygous embryos exhibit defects in cobalamin metabolism. Surprisingly however, RNA‐seq and ChIP‐seq analyses also revealed a role for ribosome biogenesis in the pathophysiology of the disease. Furthermore, we were able to show that there is also a functional deficit in ribosome biogenesis and hence protein translation. This identifies for the first time, a role for Ronin in ribosome biogenesis. Together the phenotypic and molecular data confirm that the Ronin F80L mouse model will serve as a powerful tool to further uncover the pathophysiology of this complex family of diseases. Support or Funding Information Baylor College of Medicine, Department of Molecular Physiology and Biophysics (Seed) This abstract is from the Experimental Biology 2019 Meeting. There is no full text article associated with this abstract published in The FASEB Journal .

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,009

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,019
Tête enseignante GPT0,273
Écart entre enseignants0,254 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueThe FASEB Journal→Même sujetFolate and B Vitamins Research→Travaux en français237 207→