A Novel Monomodular and Multifunctional Processive β‐1,4‐Endoglucanase Has Been Identified and Characterized from Porcine Gut Microbiome
Notice bibliographique
Résumé
Cellulose‐degrading enzymes play an important role in dietary fibre digestion of humans and animals, as well as in multiple industrial applications. Herein, a plasmid metagenomic expression library was constructed for mining cellulose‐degrading enzymes from the pig hindgut microbiota that was modulated by feeding a purified crystalline cellulose supplemented diet (Journal of Animal Science, 2012, 90 (Suppl. 4):400–402). One of the cellulase genes screened from this library was localized to a 2949‐base pair insert fragment p4818. Within the sequence preceding this enzyme‐coding region, ‐10 and ‐35 promoter elements were identified along with three transcription‐factor binding sites. The enzyme possesses a catalytic domain consistent with those of the glycoside hydrolase family 5 subfamily 2 (GH5_2), thus named as p4818Cel5_2A. The protein was overexpressed, purified, and characterized; and it displayed optimal enzymatic activity at pH 6.0 and 50 °C. The enzyme also exhibited resilience to trypsin digestion, where >70 % activity was retained after 6.0 h incubation with trypsin at 37 °C. p4818Cel5_2A exhibited a broad substrate profile with the highest specific activity towards β‐glucan, carboxymethyl cellulose (CMC), followed by hydroxyethyl‐cellulose and regenerated amorphous cellulose (RAC). The enzyme was also active on other substrates including crystalline cellulose substrates such as Avicel and Solkafloc, as well as the hemicelluloses of glucomannan and xyloglucan. Furthermore, based on viscosity and hydrolysis product analyses, the enzyme behaved like a typical endo‐β‐1,4‐glucanase, and displayed processivity towards RAC. In summary, p4818Cel5_2A exhibited novel enzyme properties for potential industrial applications. Support or Funding Information Related research activities have been supported by grants (to M.Z.F.) from the Ontario Ministry of Agriculture, Food and Rural Affairs (OMAFRA) New Directions & Alternative Renewable Fuels Research Program; and the University of Guelph Gryphon's LAAIR (Leading to Accelerated Adoption of Innovative Research) program. This abstract is from the Experimental Biology 2018 Meeting. There is no full text article associated with this abstract published in The FASEB Journal .
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».