Cloning and characterization of novel CTP: phosphoethanolamine cytidylyltransferase (Pcyt2) isoforms made by alternative splicing
Notice bibliographique
Résumé
Pcyt2 controls the rate limiting step of de novo biosynthesis of phosphatidylethanolamine. We previously identified the exon‐7 skipping as a mechanism for alternative splicing of two different Pcyt2 isoforms, Pcyt2α and Pcyt2β. Homology searches of genome databases indicated the presence of additional Pcyt2 transcripts. In order to isolate and characterize those alternative transcripts, we used total cDNA prepared from C 2 C 12 and multiple mouse tissues. Methodology included specific PCR amplification, cloning into pGEMt vector and sequencing. We detected two distinctive Pcyt2 isoforms, named γ1 and γ2. The Pcyt2γ1 is a longer form, composed of exons 1–8 and two additional regions from introns 7 and 8. The first intronic segment of 184 bp located at the beginning of intron 7 was named γ‐specific region 1. Next, exon 8 was followed by 258 bp of sequence from intron 8, named γ‐specific region 2. The new isoforms resemble the first half of Pcyt2α in containing the first catalytic site and in maintaining the exon 7 linker peptide region. Pcyt2γ1 contains two additional regions made of partial introns 7 and 8, while Pcyt2γ2 retains only parts of intron 8. This composition made the C‐terminal ends of both γ1 and γ2 completely different from isoform Pcyt2α. Both isororms were expressed in different mouse tissues as well as in mouse embryos at different stages of development. This research was supported by CIHR research grant.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».