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Enregistrement W3176939660 · doi:10.1096/fasebj.26.1_supplement.394.4

<i>Giardia duodenalis</i> : A model of pathogen‐mediated disruptions in the human microbiota in leading to the development of chronic gastrointestinal disease

2012· article· en· W3176939660 sur OpenAlexafffund
Jennifer Beatty, Sarah Akierman, Howard Ceri, Kevin P. Rioux, Paul L. Beck, André G. Buret

Notice bibliographique

RevueThe FASEB Journal · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueParasitic Infections and Diagnostics
Établissements canadiensUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésGiardiaBiofilmMicrobiologyEnterocyteBiologyPathogenBifidobacteriumHuman pathogenIrritable bowel syndromeBacteriaSmall intestineLactobacillusMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Giardia duodenalis is a key pathogen causing post‐infectious Irritable Bowel Syndrome (PI‐IBS) symptoms. Underlying mechanisms are unknown, but disruptions in species distribution of the intestinal microbiota in IBS patients have been reported. The intestinal microflora exists in biofilm communities, and the effects of enteropathogens on this phenotype, in the context of PI‐IBS, remain obscure. Aim To study effects of Giardia on the structure, species, and pathogenic profile of microflora biofilms. Methods Representative intestinal mucosal biofilms were cultured from human colonic mucosal biospy samples. Results Giardia enhances the presence of Clostridiales spp. in microflora biofilms. Giardia promotes planktonic growth in microflora biofilms by disrupting normal polysaccharide production. Giardia ‐exposed biofilms induce higher levels of enterocyte apoptosis than ones incubated with control biofilms. Conclusion Giardia exposed biofilms exhibit altered structure and species composition in human microflora biofilms, and promote enterocyte apoptosis, highlighting detrimental effects of a pathogen‐modified microflora in the bowel. Supported by NSERC

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,027
Tête enseignante GPT0,280
Écart entre enseignants0,253 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2012
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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