Cell cycle‐dependent binding of replication and transcription proteins to the human DBF4 ori
Notice bibliographique
Résumé
We have previously identified an origin of DNA replication (ori) at the transcriptional promoter of the human DBF4 gene. Using a novel replication initiation point (RIP) mapping procedure, we have shown that replication from the DBF4 ori initiates from multiple potential start‐sites which are distributed within two zones separated by ~400‐bp on the complementary DNA strands. Initiation from the two replication zones occurs sequentially, which we termed asymmetric bidirectional replication (ABR). Using chromatin immunoprecipitation (ChIP) assays we have studied protein‐DNA interactions at the DBF4 ori during cell cycle progression. Our data show that the origin recognition complex (ORC) binds to both replication zones simultaneously during late G1. However, during the G1/S transition and following S‐phase entry, ORC is sequentially released from its binding sites, mirroring the ABR pattern. ChIP data also suggests that binding of the Sp1 transcription factor and replication proteins to the DBF4 locus is mutually exclusive. This data is consistent with the idea that transcription and replication are inversely correlated at the DBF4 locus. Overall, this study provides new insight into how DNA replication and transcriptional activities are regulated in a concerted manner at ori/promoters in mammalian cells. This work was supported by grants from the Canadian Institutes of Health Research to H.L.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».