Polymorphisms in 5′UTR of ENaC α, β and γgenes in Dahl and Wistar rats
Notice bibliographique
Résumé
The activity of the epithelial sodium channel (ENaC) in the kidney is elevated in salt sensitive (SS) versus salt resistant (SR) Dahl rats. Blockade of ENaC in the brain by benzamil prevents the increase in BP in SS Dahl rats on high salt diet. Previously, we did a comprehensive screening of the complete coding regions of ENaC α, β and γ genes and no differences were identified in SS versus SR Dahl rats. In the presentstudy, we assessed whether the promotor regions of ENaC genes might harbor genetic variation(s) that enhance ENaC expression and contribute to salt sensitivity in Dahl SS, but not SR rats. Methods Screening 5′UTR of ENaC genes in Dahl SS, SR and control Wistar rats by Denaturing High Performance Liquid Chromatography (DHPLC) and automatic sequencing. Results Screening 2.2, 1.5, and 2.2 kb of 5′UTR of ENaCα, β and γ respectively showed no differences between Dahl SS and SR rats. A total of 18 SNPs; 4 SNPs in ENaCα 5′UTR, 2 in ENaCβ5′UTR, and 12 in ENaCγ 5′UTR were identified in Dahl SS and SR rats. 4 of these 18 SNPs were previously identified in the genome database of Brown Norway rats. The remaining 14 SNPs are novel polymorphisms. Of these 14 SNPs, 13 were also identified in Wistar rats. None of the identified SNPs in the 5′UTR of ENaC genes were located within the previously reported regulatory element DNA consensus sequences. Conclusions The first comprehensive screening of ENaC genes 5′UTR did not reveal any differences between SS and SR. Therefore, we could not link differences in activity of ENaC in SS versus SR to differences in ENaC 5′UTR sequences. The identified variations in ENaC genes 5′UTR on their own can not explain salt‐sensitive hypertension in Dahl SS rats.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».