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Enregistrement W3177118857 · doi:10.1096/fasebj.20.4.a310-d

Polymorphisms in 5′UTR of ENaC α, β and γgenes in Dahl and Wistar rats

2006· article· en· W3177118857 sur OpenAlexaff
Marlene Shehata, Frans H. H. Leenen, Frédérique Tesson

Notice bibliographique

RevueThe FASEB Journal · 2006
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueIon Transport and Channel Regulation
Établissements canadiensUniversity of Ottawa
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésEpithelial sodium channelSingle-nucleotide polymorphismUntranslated regionGeneThree prime untranslated regionBiologyGeneticsPromoterMolecular biologyInternal medicineEndocrinologyGene expressionMessenger RNAMedicineGenotypeSodiumChemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The activity of the epithelial sodium channel (ENaC) in the kidney is elevated in salt sensitive (SS) versus salt resistant (SR) Dahl rats. Blockade of ENaC in the brain by benzamil prevents the increase in BP in SS Dahl rats on high salt diet. Previously, we did a comprehensive screening of the complete coding regions of ENaC α, β and γ genes and no differences were identified in SS versus SR Dahl rats. In the presentstudy, we assessed whether the promotor regions of ENaC genes might harbor genetic variation(s) that enhance ENaC expression and contribute to salt sensitivity in Dahl SS, but not SR rats. Methods Screening 5′UTR of ENaC genes in Dahl SS, SR and control Wistar rats by Denaturing High Performance Liquid Chromatography (DHPLC) and automatic sequencing. Results Screening 2.2, 1.5, and 2.2 kb of 5′UTR of ENaCα, β and γ respectively showed no differences between Dahl SS and SR rats. A total of 18 SNPs; 4 SNPs in ENaCα 5′UTR, 2 in ENaCβ5′UTR, and 12 in ENaCγ 5′UTR were identified in Dahl SS and SR rats. 4 of these 18 SNPs were previously identified in the genome database of Brown Norway rats. The remaining 14 SNPs are novel polymorphisms. Of these 14 SNPs, 13 were also identified in Wistar rats. None of the identified SNPs in the 5′UTR of ENaC genes were located within the previously reported regulatory element DNA consensus sequences. Conclusions The first comprehensive screening of ENaC genes 5′UTR did not reveal any differences between SS and SR. Therefore, we could not link differences in activity of ENaC in SS versus SR to differences in ENaC 5′UTR sequences. The identified variations in ENaC genes 5′UTR on their own can not explain salt‐sensitive hypertension in Dahl SS rats.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,218
Score d'incertitude au seuil0,145

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,199
Écart entre enseignants0,193 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2006
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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