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Enregistrement W3177237293 · doi:10.1096/fasebj.2019.33.1_supplement.72.1

Mouse models of human craniofacials spliceosomopathies: Are they neurocristopathies?

2019· article· en· W3177237293 sur OpenAlexaffabout
Loydie A. Jerome‐Majewska, Marie‐Claude Beauchamp, Anissa Djedid, Kévin Daupin, Kayla Clokie, Shruti Kumar, Sabrina Alam, Jacek Majewski

Notice bibliographique

RevueThe FASEB Journal · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRNA Research and Splicing
Établissements canadiensMcGill UniversityMcGill Genome CentreMcGill University Health Centre
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyIntronGeneticsRNA splicingExonMolecular biologyCell biologyGeneRNA

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Splicing, the removal of introns from pre‐messenger RNA is an essential step for expression of most genes in multicellular organisms and for expanding the number of proteins coded by genomes. Recently, exome sequencing revealed that mutations in splicing factors and small nuclear ribonucleoprotein particles (snRNPs) which form core components of the spliceosome, are responsible for craniofacial malformations. Our group used in situ hybridization to examine expression of three core components of the spliceosome: Eftud2 – mutated in patients with mandibulofacial dysostosis, Guion‐Almeida type (MFDGA); SnrpB – responsible for Cerebrocostomandibular Syndrome (CMS); and Sf3b4 which is responsible for Nager syndrome. Herein, we report expression of Eftud2, Sf3b4 and SnrpB during craniofacial development. In addition, we used CRISPR/Cas9 to generate mice with deletion ( Eftud2 del) and conditional mutation of exon 2 of Eftud2 (Eftud2 flox) . At embryonic days (E) 7.5 and 8.5, Eftud2 was highly expressed in ectodermal and mesodermal components of the future craniofacial region, by E9.5 expression was also found in the body wall and developing heart. Eftud2 del heterozygous mice were viable and fertile, though these embryos showed reduced levels of Eftud2 mRNA and protein. In contrast, Eftud2 del homozygous mutant embryos arrest at E3.5 and failed to grow and hatch ex vivo . To examine the requirement for Eftud2 in neural crest cells, the Wnt1‐Cre2 transgenic line was used to delete exon 2 of Eftud2 specifically in that lineage. Eftud2 flox homozygous mutant embryos carrying the Wnt1‐Cre2 transgene displayed hypoplasia of the midbrain and pharyngeal arches starting at E9.5. By E11.5, most embryos also had an open neural tube and all embryos showed exencephaly at E14.5. Cartilage preparations revealed an absence of cartilage in the head, reduction/or absence of Meckel's cartilage, and abnormal inner ear development. Since deletion of exon 2 is predicted to generate a truncated protein with partial function, our data suggest that normal levels of Eftud2 is crucial in neural crest cells for normal craniofacial development. Future studies are focused on elucidating the molecular and transcriptional basis of MFDM using this mouse model. Support or Funding Information Canadian Institute of Health Research (MOP#142452) This abstract is from the Experimental Biology 2019 Meeting. There is no full text article associated with this abstract published in The FASEB Journal .

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,006
Score d'incertitude au seuil0,021

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0020,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0020,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0060,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,268
Écart entre enseignants0,248 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2019
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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