Regulation of GTPase function by autophosphorylation
Notice bibliographique
Résumé
SUMMARY A unifying feature of the RAS superfamily is a functionally conserved GTPase cycle that proteins use to transition between active and inactive states. Here, we demonstrate that active site autophosphorylation of some small GTPases is an intrinsic regulatory mechanism that reduces nucleotide hydrolysis and enhances nucleotide exchange, thus altering the on/off switch that forms the basis for their signaling functions. Using x-ray crystallography, nuclear magnetic resonance spectroscopy, biolayer interferometry binding assays, and molecular dynamics on autophosphorylated mutants of H-RAS and K-RAS, we show that phosphoryl transfer from GTP requires dynamic movement of the switch II domain and that autophosphorylation promotes nucleotide exchange by opening of the active site and extraction of the stabilizing Mg. Finally, we demonstrate that autophosphorylated K-RAS exhibits altered effector interactions, including a reduced affinity for RAF proteins. Thus, autophosphorylation leads to altered active site dynamics and effector interaction properties, creating a pool of GTPases that are functionally distinct from the non-phosphorylated counterpart.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».