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Enregistrement W3177942710 · doi:10.1073/pnas.2105195118

Structural basis for potassium transport in prokaryotes by KdpFABC

2021· article· en· W3177942710 sur OpenAlexfundno aff
Marie Sweet, Casper K. Larsen, Xihui Zhang, Michael Schlame, Bjørn Panyella Pedersen, David L. Stokes

Notice bibliographique

RevueProceedings of the National Academy of Sciences · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueIon Transport and Channel Regulation
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesOffice of ScienceNational Institutes of HealthAarhus Universitets ForskningsfondBiological and Environmental ResearchEuropean CommissionNational Institute of General Medical SciencesAarhus UniversitetSimons FoundationYork UniversityU.S. Department of Energy
Mots-clésCytoplasmProtein subunitBiophysicsChemistryIon transporterATPaseATP hydrolysisStereochemistryTransporterSUPERFAMILYStructural biologyBiochemistryMembraneEnzymeBiologyReceptorGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Significance Potassium is the major intracellular cation in all kingdoms of life. In bacteria, potassium is used to maintain membrane potential, pH, and to provide turgor pressure for cell growth and division. When external potassium levels are low, an ATP-dependent pump called KdpFABC is essential to maintain intracellular potassium levels. This protein complex comprises a subunit descending from potassium channels and another from P-type ATPases. We used cryogenic electron microscopy to investigate this unique partnership and to address mechanisms of energy coupling and transport. We present structures corresponding to all major reaction intermediates and map distinct densities along the proposed transport pathway. Based on this data, we describe a mechanism that is unique amongst known membrane transporters.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,101
Score d'incertitude au seuil0,162

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,022
Tête enseignante GPT0,275
Écart entre enseignants0,254 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations35
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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