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Enregistrement W3178736812 · doi:10.1158/1538-7445.am2021-2974

Abstract 2974: Loss of <i>TSC1</i> or <i>TSC2</i> drives lineage infidelity and hamartoma formation in a renal organoid model of angiomyolipoma

2021· article· en· W3178736812 sur OpenAlexaff
Adam Pietrobon, Sean P. Delaney, Carole Doré, Julien Yockell‐Lelièvre, Lisa M. Julian, William L. Stanford

Notice bibliographique

RevueCancer Research · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueRenal cell carcinoma treatment
Établissements canadiensHealth CanadaOttawa Hospital
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésTSC1AngiomyolipomaBiologyTSC2OrganoidmTORC1Induced pluripotent stem cellLineage markersPathologyCancer researchCell biologyKidneyStem cellPI3K/AKT/mTOR pathwayProgenitor cellGeneticsMedicineGeneSignal transductionEmbryonic stem cell

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Renal angiomyolipomas (R-AMLs) are hamartomatous kidney tumors which stain positively for markers of adipocytic, vascular, smooth muscle, and melanocytic lineages. These lesions possess loss of function mutations in either TSC1 or TSC2, which are canonical negative regulators of mTORC1 signaling. To date, there exists no in vitro or in vivo model which faithfully recapitulates the architectural and molecular complexity of R-AMLs. Considering these lesions can be detected very early in life- even congenitally- we hypothesized they arise as a consequence of aberrant tissue development. To test this hypothesis, we generated TSC1-/- and TSC2-/- mutants in four human pluripotent stem cell (hPSC) backgrounds using CRISPR/Cas9 genome engineering. Wild type hPSCs differentiated into renal organoids express markers of the glomerulus, proximal and distal tubules, in a topology that resembles human nephron patterning. Remarkably, wild type renal organoids downregulate mTORC1 signaling compared to adjacent undifferentiated cells. In contrast, both TSC1-/- and TSC2-/- hPSCs exhibit substantial lineage infidelity upon differentiation, staining positively for adipocytic and melanocytic markers which are absent in matched wild type controls. Additionally, knockout lines formed nodular growths with disorganized architecture, resembling the hamartomatous organization of R-AML lesions. These lesions exhibit hyperactive mTORC1 signaling, consistent with human pathology. Together, these data suggest three primary findings: loss of TSC1/2 drives lineage infidelity; TSC1/2 may be required for architectural organization of the kidney parenchyma; and a developmental approach to R-AML modelling may best recapitulate the human disease. Citation Format: Adam Pietrobon, Sean P. Delaney, Carole Doré, Julien Yockell-Lelievre, Lisa Julian, William L. Stanford. Loss of TSC1 or TSC2 drives lineage infidelity and hamartoma formation in a renal organoid model of angiomyolipoma [abstract]. In: Proceedings of the American Association for Cancer Research Annual Meeting 2021; 2021 Apr 10-15 and May 17-21. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2021;81(13_Suppl):Abstract nr 2974.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,011

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,096
Tête enseignante GPT0,382
Écart entre enseignants0,287 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2021
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