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Enregistrement W3178789045 · doi:10.1093/cid/ciab607

Long-Term Persistence of Spike Protein Antibody and Predictive Modeling of Antibody Dynamics After Infection With Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus 2

2021· article· en· W3178789045 sur OpenAlexaff
Louis Grandjean, Anja Saso, Arturo Torres Ortiz, Tanya Lam, James Hatcher, Rosie Thistlethwayte, Mark Harris, Timothy Best, Marina Johnson, Helen R. Wagstaffe, Elizabeth Ralph, Annabelle Mai, Caroline Colijn, Judith Breuer, Matthew Buckland, Kimberly Gilmour, David Goldblatt, Dorcas Mirambe-Korsah, Fernanda Fenn Torrente, Jakub Wyszynski, Victoria Gander, Amy Leonard, Louise Myers, Aimee Vallot, Camille Paillas, Rose Fitzgerald, Adam Twigg, Rabia Manaf, Lois Gibbons, Hollie Powell, Richard Nar-Dorh, A. H. Gray, Elías Carrocera Fernández, Aline Minja, Emily Beech, Waffa Girshab, Pei Shi Chia, Kate Webb, Malti Nakrani, Kim Gardiner, Valerija Karaluka, Karen Ryan, Dorothy Lee Katie Groves, Hamad Khan, Shamime Nsubuga, Olivia Rosie-Wilkinson, Julia Spires, Nuria Sanchez-Clemente, Sapriya Kaur, Natasha Carroll, Jemma Efford, Gabriel Bredin, Celma Marisa Dos Santos Domingues, Sophie Foxall, Helen Ashton, Abbey Afzal, Sally Mainland, Kate Crumpler, Lucinda Dawson, Claire M. Smith, Maria Tabbu, Laura Chiverton, Jade Sugars, Jordan Mooney, Dorothy Chikusu, Fariba Tahami, Baratth Samy, Shomona Begum, Dhimple Patel, Philippa Wiltshire, Annie Susay, Anna Ryan, Luke Lancaster, Kavita Thind, Kate Speller, Rachel Sterling, Connor Tugulu, Sandhya Ghurburrun, Steffi Gray, Joy Mugas, Moe Kishma, Kathleen Akpokomua, Sophie White, Eleana Pieri, Sabina Shamsad, Demi Alexandrou, Odera Aguele, Katherine Miles, Anamika Jain, Subishma Gautam, Oliver Simms, Rachel Goff, Zarif Shams, Tinya Chirinda, Aaliya Nur, Tarekur Rahman

Notice bibliographique

RevueClinical Infectious Diseases · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueSARS-CoV-2 and COVID-19 Research
Établissements canadiensSimon Fraser University
Organismes subventionnairesNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesNational Institutes of HealthNational Institute for Health and Care ResearchWellcome Trust
Mots-clésAntibodyMedicineImmunologySerologyConfidence intervalAntibody titerPersistence (discontinuity)Respiratory systemImmunoglobulin GVirologyTiterInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Antibodies to severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) have been shown to neutralize the virus in vitro and prevent disease in animal challenge models on reexposure. However, the current understanding of SARS-CoV-2 humoral dynamics and longevity is conflicting. METHODS: The COVID-19 Staff Testing of Antibody Responses Study (Co-Stars) prospectively enrolled 3679 healthcare workers to comprehensively characterize the kinetics of SARS-CoV-2 spike protein (S), receptor-binding domain, and nucleoprotein (N) antibodies in parallel. Participants screening seropositive had serial monthly serological testing for a maximum of 7 months with the Meso Scale Discovery Assay. Survival analysis determined the proportion of seroreversion, while 2 hierarchical gamma models predicted the upper and lower bounds of long-term antibody trajectory. RESULTS: A total of 1163 monthly samples were provided from 349 seropositive participants. At 200 days after symptoms, >95% of participants had detectable S antibodies, compared with 75% with detectable N antibodies. S antibody was predicted to remain detectable in 95% of participants until 465 days (95% confidence interval, 370-575 days) using a "continuous-decay" model and indefinitely using a "decay-to-plateau" model to account for antibody secretion by long-lived plasma cells. S-antibody titers were correlated strongly with surrogate neutralization in vitro (R2 = 0.72). N antibodies, however, decayed rapidly with a half-life of 60 days (95% confidence interval, 52-68 days). CONCLUSIONS: The Co-Stars data presented here provide evidence for long-term persistence of neutralizing S antibodies. This has important implications for the duration of functional immunity after SARS-CoV-2 infection. In contrast, the rapid decay of N antibodies must be considered in future seroprevalence studies and public health decision-making. This is the first study to establish a mathematical framework capable of predicting long-term humoral dynamics after SARS-CoV-2 infection. CLINICAL TRIALS REGISTRATION: NCT04380896.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,016
Score d'incertitude au seuil0,032

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,051
Tête enseignante GPT0,397
Écart entre enseignants0,346 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations58
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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