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Enregistrement W3179690541 · doi:10.1093/biomethods/bpab004

Optimization and biological validation of an <i>in vitro</i> assay using the transfected Dm28c/pLacZ <i>Trypanosoma cruzi</i> strain

2021· article· en· W3179690541 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueBiology Methods and Protocols · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueTrypanosoma species research and implications
Établissements canadiensWestern University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésTrypanosoma cruziNifurtimoxAmastigoteBenznidazoleBioassayIn vitroStrain (injury)In vitro toxicologyChagas diseaseMolecular biologyBiologyChemistryMicrobiologyBiochemistryVirologyParasite hostingLeishmania

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract There is an urgent need to develop safer and more effective drugs for Chagas disease, as the current treatment relies on benznidazole (BZ) and nifurtimox (NFX). Using the Trypanosoma cruzi Dm28c strain genetically engineered to express the Escherichia coli β-galactosidase gene, lacZ, we have adapted and validated an easy, quick and reliable in vitro assay suitable for high-throughput screening for candidate compounds with anti-T. cruzi activity. In vitro studies were conducted to determine trypomastigotes sensitivity to BZ and NFX from Dm28c/pLacZ strain by comparing the conventional labour-intensive microscopy counting method with the colourimetric assay. Drug concentrations producing the lysis of 50% of trypomastigotes (lytic concentration 50%) were 41.36 and 17.99 µM for BZ and NFX, respectively, when measured by microscopy and 44.74 and 38.94 µM, for the colourimetric method, respectively. The optimal conditions for the amastigote development inhibitory assay were established considering the parasite–host relationship (i.e. multiplicity of infection) and interaction time, the time for colourimetric readout and the incubation time with the β-galactosidase substrate. The drug concentrations resulting in 50% amastigote development inhibition obtained with the colourimetric assay were 2.31 µM for BZ and 0.97 µM for NFX, similar to the reported values for the Dm28c wild strain (2.80 and 1.5 µM, respectively). In summary, a colourimetric assay using the Dm28c/pLacZ strain of T. cruzi has been set up, obtaining biologically meaningful sensibility values with the reference compounds on both trypomastigotes and amastigotes forms. This development could be applied to high-throughput screening programmes aiming to identify compounds with anti-T. cruzi in vitro activity.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,380
Score d'incertitude au seuil0,306

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,135
Tête enseignante GPT0,483
Écart entre enseignants0,348 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle