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Enregistrement W3180287097 · doi:10.1101/2021.07.07.447795

Protease activities of vaginal <i>Porphyromonas</i> species disrupt coagulation and extracellular matrix in the cervicovaginal niche

2021· preprint· en· W3180287097 sur OpenAlexafffund
Karen Lithgow, Vienna Buchholz, Emily Ku, Shaelen Konschuh, Ana D’Aubeterre, Laura K. Sycuro

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2021
Typepreprint
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueReproductive tract infections research
Établissements canadiensAlberta Children's HospitalUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchUniversity of CalgaryAlberta InnovatesInternational Microbiome Centre, University of CalgaryNational Institutes of HealthGovernment of Alberta
Mots-clésPorphyromonas gingivalisBiologyMicrobiologyProteasesBacteriaBiochemistryGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Porphyromonas asaccahrolytica and Porphyromonas uenonis are frequently isolated from the human vagina and are linked to bacterial vaginosis and preterm labour. However, little is known about the pathogenesis mechanisms of these bacteria. The related oral opportunistic pathogen, Porphyromonas gingivalis, is comparatively well-studied and known to secrete numerous extracellular matrix-targeting proteases. Among these are the gingipain family of cysteine proteases that drive periodontal disease progression and hematogenic transmission to the placenta. Given their phylogenetic relatedness, we hypothesized that vaginal Porphyromonas species possess gingipain-like protease activity targeting host extracellular matrix in the female reproductive tract. In this study, we demonstrate that vaginal Porphyromonas species degrade type I collagen (cervix), type IV collagen (chorioamnion/placenta), and fibrinogen, but not through the activity of gingipain orthologs. Bioinformatic queries identified 5 candidate collagenases in each species, including serine, cysteine and metalloproteases, with signal peptides directing them to the extracellular environment. Inhibition assays revealed both species secrete metalloproteases that degrade collagen and casein, while P. asaccharolytica also secretes a metalloprotease that degrades fibrinogen. Phylogenetic analysis of the predicted collagen-degrading metalloprotease revealed an orthologous relationship with the P. gingivalis endopeptidase PepO. Cloning and expression of P. asaccharolytica PepO confirmed this protein’s collagenase and caseinase activities, which have not previously been attributed to PepO homologs in other bacteria. Altogether, this description of the first known virulence factor in Porphyromonas species colonizing the human vagina sheds light on their potential to alter the structural integrity and homeostasis of reproductive tissues. Importance Porphyromonas species are common inhabitants of the vaginal microbiome, but their presence has been liked to adverse health outcomes for women, including bacterial vaginosis and preterm birth. We determined that P. asaccharolytica and P. uenonis secrete broad-acting proteases capable of freely diffusing within the cervicovaginal niche and degrading important components of host tissues, namely the extracellular matrix. We show that secreted Porphyromonas proteases degrade collagens that are enriched within the cervix (type I) and chorioamniotic membranes (type IV). Furthermore, these Porphyromonas proteases can also degrade fibrinogen and inhibit clot formation. These activities can be partially attributed to a metalloprotease that exhibits broad-acting protease activity and is distantly related to the P. gingivalis endopeptidase PepO. This initial characterization of virulence activities in vaginal Porphyromonas species highlights their potential to harm human pregnancy through clotting disruption, fetal membrane weakening, and premature cervical remodeling.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,019
Tête enseignante GPT0,256
Écart entre enseignants0,237 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2021
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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