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Enregistrement W3181587007 · doi:10.1101/2021.07.14.452331

The J domain of sacsin disrupts intermediate filament assembly

2021· preprint· en· W3181587007 sur OpenAlexafffundabout
Afrooz Dabbaghizadeh, Alexandre Paré, Zacharie Cheng-Boivin, Robin Dagher, Sandra Minotti, Marie‐Josée Dicaire, Brais Bernard, Jason C. Young, Heather D. Durham, Benoît J. Gentil

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2021
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueHeat shock proteins research
Établissements canadiensMcGill UniversityMontreal Neurological Institute and Hospital
Organismes subventionnairesMuscular Dystrophy CanadaMcGill University
Mots-clésIntermediate filamentCell biologyNeurofilamentVimentinRegulatorBiologyProtein filamentGeneChemistryCellCytoskeletonGeneticsImmunology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Autosomal Recessive Spastic Ataxia of the Charlevoix Saguenay (ARSACS), is caused by loss of function mutations in the SACS gene, which encodes sacsin, a giant protein of 520 kDa. A key feature of the absence of sacsin in cells is the formation of abnormal bundles of intermediate filaments (IF) including neurofilaments (NF) in neurons and vimentin IF in fibroblasts, suggesting a role of sacsin in IF homeostasis. Sacsin contains a J domain (SacsJ) homologous to Hsp40, that can interact with Hsp70 chaperones. The SacsJ domain resolved NF bundles in cultured Sacs -/- neurons, however, its mechanism is still unclear. Here, we focused on the role of SacsJ in NF assembly. We report that the SacsJ domain directly interacts with NF proteins in vitro to disassemble NFL filaments, and to inhibit their initial assembly, in the absence of Hsp70. We generated a cell-penetrating peptide derived from this domain, SacsJ-myc-TAT, which was efficient in disassembling both vimentin IF and NF in cultured fibroblasts and Sacs +/+ motor neurons as well as NF bundles in cultured Sacs -/- motor neurons. Whereas a normal NF network was restored in Sacs -/- neurons treated with the SacsJ peptide, there was some loss of IF networks in Sacs +/+ fibroblasts or neurons. These results suggest that SacsJ is a key regulator of NF and IF networks in cells, with implications for its therapeutic use.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,257
Écart entre enseignants0,245 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2021
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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