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Enregistrement W3181834146 · doi:10.5376/mpb.2021.12.0021

Cloning and Expression Analysis of a Salt-Stress-Induced HD-Zip Transcription Factor <i>HB-12</i> from Sunflower (<i>Helianthus annuus</i> L.)

2021· article· en· W3181834146 sur OpenAlexvenueno aff
Ruifen Sun, Yanfang Zhang, Shuchun Guo, Haifeng Yu, Suping Li, Hui Nie, Yulin An

Notice bibliographique

RevueMolecular Plant Breeding · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant-Microbe Interactions and Immunity
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyMolecular biologyComplementary DNAGenBankGeneticsTranscription factorSequence analysisCoding regionSunflowerHelianthus annuusGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

HB  transcription factor genes play a significant role in plant growth and development, including response to biotic and abiotic stresses. In this study, an HD-Zip transcription factor  HB-12  was cloned from sunflower using SMARTer RACE technology based on Unigene551_All known sequence. The full-length  HB-12 cDNA sequence is 821 bp, including 573 bp open reading frame and encoding 190 amino acids. The predicted protein molecular weight and isoelectric point are 22.55 kD and 5.58, respectively, with a homeobox domain (HD) and a homeobox-associated leucine zipper domain (HALZ). HB-12 belongs to the sunflower HD-Zip I subfamily proteins. The GenBank sequence accession number is KU315052. HB-12 protein does not exist in the transmembrane domain, and its subcellular localization predicted that it might be in the nucleus. Cluster analysis revealed that the sunflower HB-12 is closely related to the HB-12 of potato and tomato crops. Genomic DNA sequence corresponding to the full-length cDNA of  HB-12  was amplified using polymerase chain reaction (PCR). The full length of the coding region is 652 bp, and two exons are separated by one intron. The sequence has been submitted to GenBank (Accession No. KU315053). Real-time PCR analysis showed that  HB-12  expression was induced by salt, abscisic acid (ABA), and polyethylene glycol (PEG) and varied in different organs, such as roots, hypocotyls, and leaves. This study lays a foundation for research in molecular breeding of sunflower.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,091
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,022
Tête enseignante GPT0,218
Écart entre enseignants0,196 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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