Cloning and Expression Analysis of a Salt-Stress-Induced HD-Zip Transcription Factor <i>HB-12</i> from Sunflower (<i>Helianthus annuus</i> L.)
Notice bibliographique
Résumé
HB transcription factor genes play a significant role in plant growth and development, including response to biotic and abiotic stresses. In this study, an HD-Zip transcription factor HB-12 was cloned from sunflower using SMARTer RACE technology based on Unigene551_All known sequence. The full-length HB-12 cDNA sequence is 821 bp, including 573 bp open reading frame and encoding 190 amino acids. The predicted protein molecular weight and isoelectric point are 22.55 kD and 5.58, respectively, with a homeobox domain (HD) and a homeobox-associated leucine zipper domain (HALZ). HB-12 belongs to the sunflower HD-Zip I subfamily proteins. The GenBank sequence accession number is KU315052. HB-12 protein does not exist in the transmembrane domain, and its subcellular localization predicted that it might be in the nucleus. Cluster analysis revealed that the sunflower HB-12 is closely related to the HB-12 of potato and tomato crops. Genomic DNA sequence corresponding to the full-length cDNA of HB-12 was amplified using polymerase chain reaction (PCR). The full length of the coding region is 652 bp, and two exons are separated by one intron. The sequence has been submitted to GenBank (Accession No. KU315053). Real-time PCR analysis showed that HB-12 expression was induced by salt, abscisic acid (ABA), and polyethylene glycol (PEG) and varied in different organs, such as roots, hypocotyls, and leaves. This study lays a foundation for research in molecular breeding of sunflower.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».