<i>O</i>-Linked-<i>N</i>-Acetylglucosaminylation of the RNA-Binding Protein EWS N-Terminal Low Complexity Region Reduces Phase Separation and Enhances Condensate Dynamics
Notice bibliographique
Résumé
Many membraneless organelles are thought to be biomolecular condensates formed by phase separation of proteins and other biopolymers. Post-translational modifications (PTMs) can impact protein phase separation behavior, although for many PTMs this aspect of their function is unknown. O -linked β-D- N -acetylglucosaminylation ( O -GlcNAcylation) is an abundant form of intracellular glycosylation whose roles in regulating biomolecular condensate assembly and dynamics have not been delineated. Using an in vitro approach, we found that O -GlcNAcylation reduces the phase separation propensity of the EWS N -terminal low complexity region (LCR N ) under different conditions, including in the presence of the arginine- and glycine-rich RNA-binding domains (RBD). O -GlcNAcylation enhances fluorescence recovery after photobleaching (FRAP) within EWS LCR N condensates and causes the droplets to exhibit more liquid-like relaxation following fusion. Following extended incubation times, EWS LCR N +RBD condensates exhibit diminished FRAP, indicating a loss of fluidity, while condensates containing the O -GlcNAcylated LCR N do not. In HeLa cells, EWS is less O -GlcNAcylated following OGT knockdown, which correlates with its increased accumulation in a filter retardation assay. Relative to the human proteome, O -GlcNAcylated proteins are enriched with regions that are predicted to phase separate, suggesting a general role of O -GlcNAcylation in regulation of biomolecular condensates.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».