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Enregistrement W3184613988 · doi:10.1093/jnci/djab147

Breast and Prostate Cancer Risks for Male<i>BRCA1</i>and<i>BRCA2</i>Pathogenic Variant Carriers Using Polygenic Risk Scores

2021· article· en· W3184613988 sur OpenAlexafffund
Daniel R. Barnes, Valentina Silvestri, Goska Leslie, Lesley McGuffog, Joe Dennis, Xin Yang, Julian Adlard, Bjarni A. Agnarsson, Munaza Ahmed, Kristiina Aittomäki, Irene L. Andrulis, Aðalgeir Arason, Norbert Arnold, Bernd Auber, Jacopo Azzollini, Judith Balmañà, Rósa B. Barkardóttir, Daniel Barrowdale, Julian Barwell, Muriel Belotti, Javier Benı́tez, Pascaline Berthet, Susanne E. Boonen, Åke Borg, Anikó Bozsik, Angela F. Brady, Paul Brennan, Carole Brewer, Joan Brunet, Agostino Bucalo, Saundra S. Buys, Trinidad Caldés, Maria A. Caligo, Ian Campbell, Hayley Cassingham, Lise Lotte Christensen, Giulia Cini, Kathleen Claes, Jackie Cook, Anna Coppa, Laura Cortesi, Giuseppe Damante, Esther Darder, Rosemarie Davidson, Miguel de la Hoya, Kim De Leeneer, Robin De Putter, Jesús Del Valle, Orland Dı́ez, Yuan Chun Ding, Susan M. Domchek, Alan Donaldson, Jacqueline Eason, Rosalind A. Eeles, Christoph Engel, D. Gareth Evans, Lídia Feliubadaló, Florentia Fostira, Megan N. Frone, Debra Frost, David Gallagher, Andrea Gehrig, Sophie Giraud, Gord Glendon, Andrew K. Godwin, David E. Goldgar, Mark H. Greene, Helen Gregory, Eva Groß, Eric Hahnen, Ute Hamann, Thomas van Overeem Hansen, Helen Hanson, Julia Hentschel, Judit Horváth, Louise Izatt, Á. Izquierdo, Paul A. James, Ramūnas Janavičius, Uffe Birk Jensen, Oskar T. Johannsson, Esther M. John, Gero Kramer, Lone Kroeldrup, Torben A. Kruse, Charlotte Kvist Lautrup, Conxi Lázaro, Fabienne Lesueur, Adrià López‐Fernández, Siranoush Manoukian, Zoltán Mátrai, Laura Matricardi, Kara N. Maxwell, Noura Mebirouk, Alfons Meindl, Marco Montagna, Álvaro N.A. Monteiro, Patrick J. Morrison, Taru Muranen, Alex Murray, Katherine L. Nathanson, Susan L. Neuhausen, Heli Nevanlinna, Tú Nguyen‐Dumont, Dieter Niederacher, Edith Oláh, Olufunmilayo I. Olopade, Domenico Palli, Michael T. Parsons, Inge Søkilde Pedersen, Bernard Peissel, Pedro Pérez‐Segura, Paolo Peterlongo, Annabeth Høgh Petersen, Pedro Pinto, Mary Porteous, Caroline Pottinger, Miquel Angel Pujana, Paolo Radice, Juliane Ramser, Johanna Rantala, Mark E. Robson, Mark T. Rogers, Karina Rønlund, Andreas Rump, A.M. SÁnchez De Abajo, Payal D. Shah, Saba Sharif, Lucy Side, Christian F. Singer, Zsofia Stadler, Linda Steele, Dominique Stoppa‐Lyonnet, Christian Sutter, Yen Y. Tan, Manuel R. Teixeira, Àlex Teulé, Darcy L. Thull, Marc Tischkowitz, Amanda E. Toland, Stefania Tommasi, Angela Toss, Alison H. Trainer, Vishakha Tripathi, Virginia Valentini, Christi J. van Asperen, Marta Venturelli, Alessandra Viel, Joseph Vijai, Lisa Walker, Shan Wang‐Gohrke, Barbara Wappenschmidt, Anna Whaite, Ines Zanna, Kenneth Offit, Mads Thomassen, Fergus J. Couch, Rita K. Schmutzler, Jacques Simard, Douglas F. Easton, Georgia Chenevix‐Trench, Antonis C. Antoniou, Laura Ottini

Notice bibliographique

RevueJNCI Journal of the National Cancer Institute · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBRCA gene mutations in cancer
Établissements canadiensUniversité LavalMcGill UniversityCentre hospitalier universitaire de QuébecMount Sinai HospitalLunenfeld-Tanenbaum Research InstituteUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesJonsson Comprehensive Cancer CenterNational Center for Advancing Translational SciencesNational Cancer InstituteMedical Research CouncilCanadian Institutes of Health ResearchUniversity of California, Los AngelesNational Institutes of HealthKerry Group Kuok FoundationFreistaat SachsenCentro de Investigación Biomédica en Red de CáncerFox Chase Cancer CenterMinistero dello Sviluppo EconomicoHospices Civils de LyonDeutsche KrebshilfeAssociazione Italiana per la Ricerca sul CancroEuropean Regional Development FundCentre National de la Recherche ScientifiqueLietuvos Mokslo TarybaUniversity of California, San FranciscoUniversiteit GentOvarian Cancer Research FundMinisterio de Economía y CompetitividadLandspítali HáskólasjúkrahúsHungarian Scientific Research FundKorea Health Industry Development InstituteKWF KankerbestrijdingUniversitair Ziekenhuis GentNederlandse Organisatie voor Wetenschappelijk OnderzoekInstitut National de la Santé et de la Recherche MédicaleMinistero della SaluteGeneralitat de CatalunyaRussian Foundation for Basic ResearchCancer Association of South AfricaMinisterstvo Školství, Mládeže a TělovýchovyNational Breast Cancer FoundationEuropean CommissionNemzeti Kutatási Fejlesztési és Innovációs HivatalNational Institute for Health and Care ResearchCancer Research UKGovernment of CanadaMinistero dell’Istruzione, dell’Università e della RicercaNRG OncologyMemorial Sloan-Kettering Cancer CenterFondation du cancer du sein du QuébecCedars-Sinai Medical CenterIsrael Cancer AssociationInstitut Gustave-RoussyUniversity of PennsylvaniaFundación Mutua MadrileñaMinistère du Développement Économique, de l’Innovation et de l’ExportationBreast Cancer Research FoundationUniverzita Karlova v PrazeMcGill UniversityNational Institute of General Medical SciencesInstitut National Du CancerDipartimenti di EccellenzaGenome CanadaUnicancerClalit Health ServicesDeutsches KrebsforschungszentrumKræftens BekæmpelseNIH Office of the DirectorMinistério da Ciência, Tecnologia e InovaçãoKansas Bioscience AuthorityDr. Ralph and Marian Falk Medical Research TrustSusan G. Komen for the CureGeorgetown UniversityFonds Wetenschappelijk OnderzoekCancer Center, University of KansasCancerfondenCancer AustraliaNational Health and Medical Research CouncilJewish General HospitalFisher Center for Alzheimer's Research FoundationInstituto de Salud Carlos IIIOhio State UniversityBeth Israel Deaconess Medical CenterIstituto Oncologico VenetoRoyal Marsden NHS Foundation TrustEuropean Social FundUniversity of Chicago
Mots-clésOncologyMedicineProstate cancerBreast cancerLifetime riskInternal medicineProstatePolygenic risk scoreCancerGynecologyBiologyGeneticsGeneGenotype

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Recent population-based female breast cancer and prostate cancer polygenic risk scores (PRS) have been developed. We assessed the associations of these PRS with breast and prostate cancer risks for male BRCA1 and BRCA2 pathogenic variant carriers. METHODS: 483 BRCA1 and 1318 BRCA2 European ancestry male carriers were available from the Consortium of Investigators of Modifiers of BRCA1/2 (CIMBA). A 147-single nucleotide polymorphism (SNP) prostate cancer PRS (PRSPC) and a 313-SNP breast cancer PRS were evaluated. There were 3 versions of the breast cancer PRS, optimized to predict overall (PRSBC), estrogen receptor (ER)-negative (PRSER-), or ER-positive (PRSER+) breast cancer risk. RESULTS: PRSER+ yielded the strongest association with breast cancer risk. The odds ratios (ORs) per PRSER+ standard deviation estimates were 1.40 (95% confidence interval [CI] =1.07 to 1.83) for BRCA1 and 1.33 (95% CI = 1.16 to 1.52) for BRCA2 carriers. PRSPC was associated with prostate cancer risk for BRCA1 (OR = 1.73, 95% CI = 1.28 to 2.33) and BRCA2 (OR = 1.60, 95% CI = 1.34 to 1.91) carriers. The estimated breast cancer odds ratios were larger after adjusting for female relative breast cancer family history. By age 85 years, for BRCA2 carriers, the breast cancer risk varied from 7.7% to 18.4% and prostate cancer risk from 34.1% to 87.6% between the 5th and 95th percentiles of the PRS distributions. CONCLUSIONS: Population-based prostate and female breast cancer PRS are associated with a wide range of absolute breast and prostate cancer risks for male BRCA1 and BRCA2 carriers. These findings warrant further investigation aimed at providing personalized cancer risks for male carriers and informing clinical management.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,011

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,036
Tête enseignante GPT0,332
Écart entre enseignants0,295 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations42
Publié2021
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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