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Enregistrement W3186149217 · doi:10.1016/j.neurobiolaging.2021.07.003

Proteomic correlates of cortical thickness in cognitively normal individuals with normal and abnormal cerebrospinal fluid beta-amyloid1-42

2021· article· en· W3186149217 sur OpenAlexfundno aff
Laura L. Ekblad, Pieter Jelle Visser, Betty M. Tijms

Notice bibliographique

RevueNeurobiology of Aging · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAlzheimer's disease research and treatments
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchNational Institutes of HealthGenentechIXICOH. Lundbeck A/SServierEisaiNorthern California Institute for Research and EducationPfizerNovartis Pharmaceuticals CorporationUniversity of Southern CaliforniaBiogenEli Lilly and CompanyBristol-Myers SquibbBioClinicaU.S. Department of DefenseAlzheimer's Disease Neuroimaging InitiativeMeso Scale DiagnosticsAlzheimer's Association
Mots-clésCerebrospinal fluidCingulum (brain)AtrophyCortex (anatomy)PathologyCerebral cortexNeuroscienceBiologyAlzheimer's diseaseMedicineDiseaseWhite matterMagnetic resonance imaging

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Cortical atrophy is an early feature of Alzheimer´s disease (AD). The biological processes associated with variability in cortical thickness remain largely unknown. We studied 220 cerebrospinal fluid (CSF) proteins to evaluate biological pathways associated with cortical thickness in 34 brain regions in 79 cognitively normal older individuals with normal (>192 ng/L, n = 47), and abnormal (≤192 ng/L, n = 32) CSF beta-amyloid1-42 (Aβ42). Interactions for Aβ42 status were tested. Panther GeneOntology and Cytoscape ClueGO analyses were used to evaluate biological processes associated with regional cortical thickness. 170 (77.3 %) proteins related with cortical thickness in at least 1 brain region across the total group, and 171 (77.7 %) proteins showed Aβ42 specific associations. Higher levels of proteins related to axonal and synaptic integrity, amyloid accumulation, and inflammation were associated with thinner cortex in lateral temporal regions, the rostral anterior cingulum, the lateral occipital cortex and the pars opercularis only in the abnormal Aβ42 group. Alterations in CSF proteomics are associated with a regional cortical atrophy in the earliest stages of AD.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,018
Tête enseignante GPT0,279
Écart entre enseignants0,261 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations5
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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