MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W3186467883 · doi:10.1016/j.nicl.2021.102765

Artificial intelligence for classification of temporal lobe epilepsy with ROI-level MRI data: A worldwide ENIGMA-Epilepsy study

2021· article· en· W3186467883 sur OpenAlexafffund
Ezequiel Gleichgerrcht, Brent C. Munsell, Saud Alhusaini, Marina K. M. Alvim, Núria Bargalló, Benjamin Bender, Andrea Bernasconi, Neda Bernasconi, Boris C. Bernhardt, Karen Blackmon, Maria Eugenia Caligiuri, Fernando Cendes, Luis Concha, Patricia Desmond, Orrin Devinsky, Colin P. Doherty, Martin Domín, John S. Duncan, Niels K. Focke, Antonio Gambardella, Bo Gong, Renzo Guerrini, Sean N. Hatton, Reetta Kälviäinen, Simon S. Keller, Peter Kochunov, Raviteja Kotikalapudi, Barbara A. K. Kreilkamp, Angelo Labate, Sönke Langner, Sara Larivière, Matteo Lenge, Elaine Lui, Pascal Martin, Mario Mascalchi, Stefano Meletti, Terence J. O’Brien, Heath Pardoe, José C. Pariente, Jun Rao, Mark P. Richardson, Raúl Rodríguez‐Cruces, Theodor Rüber, Ben Sinclair, Hamid Soltanian‐Zadeh, Dan J. Stein, Pasquale Striano, Peter N. Taylor, Rhys H. Thomas, Anna Elisabetta Vaudano, Lucy Vivash, Felix von Podewills, Sjoerd B. Vos, Bernd Weber, Yi Yao, Clarissa Lin Yasuda, Junsong Zhang, Paul M. Thompson, Sanjay M. Sisodiya, Carrie R. McDonald, Leonardo Bonilha, André Altmann, Chantal Depondt, Marian Galovic, Sophia I. Thomopoulos, Roland Wiest

Notice bibliographique

RevueNeuroImage Clinical · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueEpilepsy research and treatment
Établissements canadiensBC Children's HospitalMcGill UniversityMontreal Neurological Institute and Hospital
Organismes subventionnairesNational Institute of Neurological Disorders and StrokeMedical Research CouncilFonds de Recherche du Québec - SantéNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCentre Azrieli de recherche sur l'autisme, Institut et Hôpital Neurologiques de MontréalEberhard Karls Universität TübingenUniversity College London Hospitals NHS Foundation TrustMinistero dell’Istruzione, dell’Università e della RicercaHospital for Sick ChildrenEpilepsy Research UKMinistero della SaluteConsejo Nacional de Ciencia y TecnologíaMedical Research Council Centre for Neurodevelopmental DisordersConselho Nacional de Desenvolvimento Científico e TecnológicoNational Natural Science Foundation of ChinaNational Institute of Mental HealthNational Institute on Handicapped ResearchSaastamoisen säätiöNational Health and Medical Research CouncilFundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São PauloNational Institutes of HealthSchweizerischer Nationalfonds zur Förderung der Wissenschaftlichen ForschungNational Institute for Health and Care ResearchDirección General de Asuntos del Personal Académico, Universidad Nacional Autónoma de MéxicoDeutsche ForschungsgemeinschaftFinding A Cure for Epilepsy and SeizuresCitizens United for Research in EpilepsyNational Institute of Biomedical Imaging and BioengineeringCanadian Institutes of Health ResearchEpilepsy SocietyNational Science Foundation
Mots-clésTemporal lobeEpilepsyHippocampal sclerosisMagnetic resonance imagingArtificial intelligenceDiffusion MRINeuroimagingHippocampal formationMedicineComputer sciencePsychologyRadiologyNeuroscience

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Artificial intelligence has recently gained popularity across different medical fields to aid in the detection of diseases based on pathology samples or medical imaging findings. Brain magnetic resonance imaging (MRI) is a key assessment tool for patients with temporal lobe epilepsy (TLE). The role of machine learning and artificial intelligence to increase detection of brain abnormalities in TLE remains inconclusive. We used support vector machine (SV) and deep learning (DL) models based on region of interest (ROI-based) structural (n = 336) and diffusion (n = 863) brain MRI data from patients with TLE with ("lesional") and without ("non-lesional") radiographic features suggestive of underlying hippocampal sclerosis from the multinational (multi-center) ENIGMA-Epilepsy consortium. Our data showed that models to identify TLE performed better or similar (68-75%) compared to models to lateralize the side of TLE (56-73%, except structural-based) based on diffusion data with the opposite pattern seen for structural data (67-75% to diagnose vs. 83% to lateralize). In other aspects, structural and diffusion-based models showed similar classification accuracies. Our classification models for patients with hippocampal sclerosis were more accurate (68-76%) than models that stratified non-lesional patients (53-62%). Overall, SV and DL models performed similarly with several instances in which SV mildly outperformed DL. We discuss the relative performance of these models with ROI-level data and the implications for future applications of machine learning and artificial intelligence in epilepsy care.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,011
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,028
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,011
Score d'incertitude au seuil0,059

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0110,028
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0020,002
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0020,002
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,332
Tête enseignante GPT0,465
Écart entre enseignants0,133 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations77
Publié2021
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueNeuroImage ClinicalMême sujetEpilepsy research and treatmentTravaux en français237 207