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Enregistrement W3187302100 · doi:10.1002/onco.13927

Next-Generation Sequencing in the Diagnosis of Metastatic Lesions: Reclassification of a Glioblastoma as an Endometrial Cancer Metastasis to the Brain

2021· article· en· W3187302100 sur OpenAlexaff
Shuk On Annie Leung, Olivia Foley, David B. Chapel, Annacarolina da Silva, Marisa R. Nucci, Michael G. Muto, Susana M. Campos

Notice bibliographique

RevueThe Oncologist · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCancer Genomics and Diagnostics
Établissements canadiensMcGill University Health Centre
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPTENMedicineMicrosatellite instabilityEndometrial cancerMetastasisPathologyBrain metastasisKRASImmunohistochemistryCancerLesionOncologyInternal medicineColorectal cancerBiologyMicrosatelliteGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Endometrial cancer is the most common gynecologic cancer in the U.S., but metastasis to the brain is rare, and diagnosis can be challenging. Traditional tools for determining if a tumor is a primary or metastatic lesion include pan-imaging, histopathologic studies, and immunohistochemistry. Molecular testing with next-generation sequencing has been increasingly used to augment these tests. We present a case of a patient who initially presented with a brain lesion diagnosed as glioblastoma on histology and immunohistochemistry, but whose diagnosis was later changed to metastasis from an endometrial primary based on molecular findings. The two tumors shared a common microsatellite instability signature and 51 DNA variants, including oncogenic driver mutations KRAS p.G13D, PIK3CA p.E545A, and PTEN p.I135V and p.K267Rfs*9. This highlights the power of molecular analysis in making the diagnosis in cases of rare metastases. KEY POINTS: Brain metastasis from endometrial primary is rare, and histopathological features may be augmented with molecular analysis to aid in diagnosis. Comparison of the molecular makeup of the primary endometrial lesion with the metastatic lesion may reveal high-risk molecular features that may be indicative of metastatic potential.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,047
Score d'incertitude au seuil0,998

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,138
Tête enseignante GPT0,363
Écart entre enseignants0,225 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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