Phylogenetic trees of mutant Staphylococcus aureus produce recombinant thrombolytic enzyme
Notice bibliographique
Résumé
The aim of study make Phylogenetic trees of mutant Staphylococcus aureus produce recombinant thrombolytic enzyme. Isolation S.aureus from different clinical sources from human that identified by vitek2-GP : 280 (56%) tonsils , 100 (20%) nose, 40 (8%) tumors, 17 (3.4%) urine, 27 (5.4%) skin(Acne) and 36 (7.2%) Blood. Genotypic analysis of sak gene showed presence of sak gene in all mutant VSSA and MSSA S.aureus after done chemical mutagenesis compared with control before chemical mutagenesis, size of sak gene (492bp) compared with DNA Ladder (1500bp).DNA Sequencing of S.aureus elucidate the coding region for Sak gene amplified from mutant VSSA and MSSA compared with analogous sequence of the same gene from standard strain of S.aureus possessed in BLAST / NCBI on the web site. Register strain in NCBI(National Center of Biotechnology Institute) Strain carry ID in NCBI/Gene Bank : strain1 ID=MN907801.1,strain2 ID=MN907802.1, strain3 ID=MN907803.1, strain4 ID=MN907804.1, strain5 ID=MN907805.1 and strain6 ID=MN907806.1; convert nucleotide sequence to protein by using Mega 6 program software. Phylogenetic trees drawn by neighbor-joining trees of strain based on spa-X Gene sequences for all strain that recording in NCBI/GeneBank hold accession number MN907801.1, MN907802.1, MN907803.1, MN907804.1, MN907805.1, MN9078026.1 Staphylococcus aureus IRAQ, the relativity between strain 0.9893-1.5814(99%); the relativity between 6 strain with strain in Australia 1.916(100%) 12/ CP043389.1:209416-2095276 Staphylococcus aureus Australia Meliboume; the relativity with strain 8 USA:KY America (100%), also the relativity with strain19 (100%) CP020960.1:153230:953990 Staphylococcus aureus Canada: Calgary (100%) relativity with strain(12,13,14,15,16,17,21,18), this results relativity with other strain in the world.The relativity of IRAQ strain between strain MN907801.1 with strain MN907804.1 0.8960(100%); the relativity between MN907804.1 with strain MN907805.1 is 0.9000(99%); the relativity between strain MN907801.1 and MN907805.1 is 0.3175(99%); the relativity of strain MN907801.1 with (relativity between MN907806.1, MN907805.1, MN907804.1, MN907801.1 is (99%)) 0.3038 (99%); the relativity between MN907803. (relativity between all strain) 0.2933(99%) and shown link in NCBI/GeneBank for strain recording with number 060753351. Compatibility IRAQ strain with other strain in the world is 99% in France, Japan, China(Zhejiang) province, USA (New York city),Ghana: Accra, Japan:Kyoto, Australia:Melbourne, USA:Detroit, USA:VA, China, USA:California, Canada:Calgary, USA, USA:SanDiego, Canada: Calgary.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».