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Enregistrement W3190767940 · doi:10.34133/2021/9806201

Classification of Soybean Pubescence from Multispectral Aerial Imagery

2021· article· en· W3190767940 sur OpenAlexafffund
Robert W. Bruce, Istvan Rajcan, John Sulik

Notice bibliographique

RevuePlant Phenomics · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueRemote Sensing in Agriculture
Établissements canadiensUniversity of Guelph
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCanada First Research Excellence Fund
Mots-clésArtificial intelligenceMultispectral imagePrincipal component analysisSupport vector machineCultivarNormalized Difference Vegetation IndexTest setMathematicsPattern recognition (psychology)CartographyComputer scienceGeographyHorticultureBiologyBotanyLeaf area index

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The accurate determination of soybean pubescence is essential for plant breeding programs and cultivar registration. Currently, soybean pubescence is classified visually, which is a labor-intensive and time-consuming activity. Additionally, the three classes of phenotypes (tawny, light tawny, and gray) may be difficult to visually distinguish, especially the light tawny class where misclassification with tawny frequently occurs. The objectives of this study were to solve both the throughput and accuracy issues in the plant breeding workflow, develop a set of indices for distinguishing pubescence classes, and test a machine learning (ML) classification approach. A principal component analysis (PCA) on hyperspectral soybean plot data identified clusters related to pubescence classes, while a Jeffries-Matusita distance analysis indicated that all bands were important for pubescence class separability. Aerial images from 2018, 2019, and 2020 were analyzed in this study. A 60-plot test (2019) of genotypes with known pubescence was used as reference data, while whole-field images from 2018, 2019, and 2020 were used to examine the broad applicability of the classification methodology. Two indices, a red/blue ratio and blue normalized difference vegetation index (blue NDVI), were effective at differentiating tawny and gray pubescence types in high-resolution imagery. A ML approach using a support vector machine (SVM) radial basis function (RBF) classifier was able to differentiate the gray and tawny types (83.1% accuracy and kappa = 0.740 on a pixel basis) on images where reference training data was present. The tested indices and ML model did not generalize across years to imagery that did not contain the reference training panel, indicating limitations of using aerial imagery for pubescence classification in some environmental conditions. High-throughput classification of gray and tawny pubescence types is possible using aerial imagery, but light tawny soybeans remain difficult to classify and may require training data from each field season.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,006
Score d'incertitude au seuil0,013

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,196
Écart entre enseignants0,184 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations14
Publié2021
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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