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Enregistrement W3191673291 · doi:10.1016/j.chembiol.2021.07.010

Chemogenomics identifies acetyl-coenzyme A synthetase as a target for malaria treatment and prevention

2021· article· en· W3191673291 sur OpenAlexaff
Robert L. Summers, Charisse Flerida A. Pasaje, João Pedro Pisco, Josefine Striepen, Madeline R. Luth, Krittikorn Kümpornsin, Emma F. Carpenter, Justin Munro, De Lin, Andrew Plater, Avinash S. Punekar, Andrew M. Shepherd, Sharon M. Shepherd, Manu Vanaerschot, James M. Murithi, Kelly Rubiano, Aslı Akidil, Sabine Ottilie, Nimisha Mittal, Amanda Hazel Dilmore, Madalyn M. Won, Rebecca Mandt, Kerry McGowen, Edward Owen, Chris Walpole, Manuel Llinás, Lee M, Elizabeth A. Winzeler, David A. Fidock, Ian H. Gilbert, Dyann F. Wirth, Jacquin C. Niles, Beatriz Baragaña, Amanda K. Lukens

Notice bibliographique

RevueCell chemical biology · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueMalaria Research and Control
Établissements canadiensStructural Genomics ConsortiumMcGill University Health Centre
Organismes subventionnairesNational Institute of General Medical SciencesNational Health and Medical Research CouncilNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesMedical Research CouncilHuck Institutes of the Life SciencesNational Institutes of HealthGlobal Health Innovative Technology FundUniversity of DundeeMedicines for Malaria VentureHarvard T.H. Chan School of Public HealthNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney DiseasesBill and Melinda Gates FoundationPennsylvania State UniversityWellcome TrustUniversity of Pennsylvania
Mots-clésDruggabilityGene knockdownBiologyAcetylationEpigeneticsGeneEnzymeBiochemistryIn vitroPlasmodium falciparumGeneticsCell biologyMalaria

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

We identify the Plasmodium falciparum acetyl-coenzyme A synthetase (PfAcAS) as a druggable target, using genetic and chemical validation. In vitro evolution of resistance with two antiplasmodial drug-like compounds (MMV019721 and MMV084978) selects for mutations in PfAcAS. Metabolic profiling of compound-treated parasites reveals changes in acetyl-CoA levels for both compounds. Genome editing confirms that mutations in PfAcAS are sufficient to confer resistance. Knockdown studies demonstrate that PfAcAS is essential for asexual growth, and partial knockdown induces hypersensitivity to both compounds. In vitro biochemical assays using recombinantly expressed PfAcAS validates that MMV019721 and MMV084978 directly inhibit the enzyme by preventing CoA and acetate binding, respectively. Immunolocalization studies reveal that PfAcAS is primarily localized to the nucleus. Functional studies demonstrate inhibition of histone acetylation in compound-treated wild-type, but not in resistant parasites. Our findings identify and validate PfAcAS as an essential, druggable target involved in the epigenetic regulation of gene expression.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,026
Score d'incertitude au seuil0,468

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,018
Tête enseignante GPT0,294
Écart entre enseignants0,276 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations81
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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