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Enregistrement W3192173765 · doi:10.1101/2021.08.04.454987

Local regulation of extracellular vesicle traffic by the synaptic endocytic machinery

2021· preprint· en· W3192173765 sur OpenAlexafffund
Cassandra R. Blanchette, Amy L. Scalera, Kathryn P. Harris, Zechuan Zhao, Kate Koles, Anna Yeh, Julia K. Apiki, Bryan A. Stewart, Avital A. Rodal

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2021
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCellular transport and secretion
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesNational Institute of Neurological Disorders and StrokeNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaNational Institutes of Health
Mots-clésEndocytic cycleEndosomeCell biologySynaptic vesicleSynaptic vesicle recyclingRetromerEndocytosisBiologySynaptic plasticityDynaminSynaptotagmin 1ChemistryIntracellularVesicleBiochemistryCell

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Neuronal extracellular vesicles (EVs) can be locally released from presynaptic terminals, carrying cargoes that are important in intercellular signaling and disease. EVs are derived from endosomes, but it remains unclear how synaptic cargoes are directed to the EV pathway, rather than undergoing conventional retrograde endosomal transport and degradation. Here, we find that the clathrin-mediated endocytic machinery plays an unexpected role in maintaining a release-competent pool of synaptic EV cargoes. Endocytic mutants, including nervous wreck ( nwk ), Shibire /Dynamin, and AP-2 , exhibit local depletion of multiple cargoes in EV donor terminals. Accordingly, nwk mutants phenocopy synaptic plasticity defects associated with loss of the EV cargo Synaptotagmin-4, and suppress lethality upon overexpression of the EV cargo Amyloid Precursor Protein. These EV defects are genetically separable from canonical functions of endocytic proteins in synaptic vesicle recycling and synaptic growth. This endocytic pathway opposes the endosomal retromer complex to regulate EV cargo levels, and acts upstream of synaptic cargo removal by retrograde axonal transport. Our data suggest a novel molecular mechanism that protects EV cargoes from local depletion at synapses.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,191
Écart entre enseignants0,184 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2021
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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