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Enregistrement W3192489061 · doi:10.1002/em.22457

Assessment of cellular and molecular metrics for dose selection in an <i>in vivo</i> comet assay: A case study with MDI

2021· article· en· W3192489061 sur OpenAlexfundno aff
Zhiying Ji, Matthew W. Koehler, Andrew B. Scott, Matthew J. LeBaron

Notice bibliographique

RevueEnvironmental and Molecular Mutagenesis · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCarcinogens and Genotoxicity Assessment
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesInstitute of Infection and Immunity
Mots-clésComet assayGenotoxicityCytotoxicityIn vivoDNA damageChemistryToxicityBronchoalveolar lavageMolecular biologyToxicologyPathologyBiologyBiochemistryIn vitroLungMedicineDNAInternal medicineGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract The in vivo comet assay can evaluate the genotoxic potential of a chemical in theoretically any tissue that can be processed to a single cell suspension. This flexibility enables evaluation of point‐of‐contact tissues using a relevant route of test material administration; however, assessing cytotoxicity is essential for the interpretation of comet results. Histopathological evaluation is routinely utilized to assess cytotoxicity, but temporal‐ and cell‐specific considerations may compromise applicability to the comet assay. In the present study, 1,1′‐methylenebis(4‐isocyanatobenzene) (4,4'‐MDI) was administered to rats for 6 h by nose‐only inhalation, and the comet assay was conducted to evaluate genotoxicity in the site‐of‐contact tissue (bronchoalveolar lavage cells) and distal tissues (liver and glandular stomach). Given the reactive nature of MDI, cellular and molecular metrics at the site‐of‐contact‐ including inflammation, macrophage activation, apoptosis/necrosis, and oxidative stress‐ were used to set appropriate exposure concentrations, in addition to the standard systemic measures of toxicity. In the range‐finding study, a concentration of 4 mg/m3 was considered the maximum noninflammatory concentration; hence target concentrations of 2, 5, and 11 mg/m3 were selected for the comet study. In the lung lavage, MDI exposure substantially increased total protein and β‐glucuronidase, along with cellular apoptosis. Although MDI did not increase the comet assay response (% tail DNA) in any of the tissues examined, the positive control (ethyl methanesulfonate, EMS) significantly increased % tail DNA in all tissues. In total, these data indicate that appropriate cellular and molecular measurements may facilitate dose selection to discern cellular status in the comet assay.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,011

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0020,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,250
Écart entre enseignants0,242 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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