MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W3193375219 · doi:10.1126/sciimmunol.abl4348

X-linked recessive TLR7 deficiency in ~1% of men under 60 years old with life-threatening COVID-19

2021· article· en· W3193375219 sur OpenAlexfundno aff
Takaki Asano, Bertrand Boisson, Fanny Onodi, Daniela Matuozzo, Marcela Moncada‐Vélez, Majistor Raj Luxman Maglorius Renkilaraj, Peng Zhang, Laurent Meertens, Alexandre Bolze, Marie Materna, Sarantis Korniotis, Adrian Gervais, Estelle Talouarn, Benedetta Bigio, Yoann Seeleuthner, Kaya Bilgüvar, Yu Zhang, Anna‐Lena Neehus, Masato Ogishi, Simon J. Pelham, Jérémie Rosain, Quentin Philippot, Pere Soler‐Palacín, Roger Colobrán, Andrea Martín-Nalda, Jacques G. Rivière, Yacine Tandjaoui-Lambiotte, Khalil Chaïbi, Mohammad Shahrooei, Ilad Alavi Darazam, Nasrin Alipour Olyaei, Davood Mansouri, Nevin Hatipoğlu, Figen Palabıyık, Tayfun Özçelık, Giuseppe Novelli, Antonio Novelli, Giorgio Casari, Alessandro Aiuti, Paola Carrera, Simone Bondesan, Federica Barzaghi, Patrizia Rovere-Querini, Cristina Tresoldi, José Luis Franco, Julian Rojas, Luis Felipe Reyes, Ingrid G. Bustos, Andrés A. Arias, Guillaume Morelle, Christèle Kyheng, Jesús Troya, Laura Planas‐Serra, Agatha Schlüter, Marta Gut, Aurora Pujol, Luís M. Allende, Carlos Rodríguez‐Gallego, Carlos Flores, Óscar Cabrera-Marante, Daniel E. Pleguezuelo, Rebeca Pérez de Diego, Sevgi Keleş, Gökhan Aytekіn, Özge Metin Akcan, Yenan T. Bryceson, Peter Bergman, Petter Brodin, Daniel Smole, Smith Rjh, Anna-Carin Norlin, Tessa M. Campbell, Laura Covill, Lennart Hammarström, Qiang Pan‐Hammarström, Hassan Abolhassani, Shrikant Mane, Nico Marr, Manar Ata, Fatima Al Ali, Taushif Khan, András N. Spaan, Clifton L. Dalgard, Paolo Bonfanti, Andrea Biondi, Sarah Tubiana, Charles Burdet, Robert L. Nussbaum, Amanda Kahn-Kirby, Andrew L. Snow, Jacinta Bustamante, Anne Puel, Stéphanie Boisson‐Dupuis, Shen‐Ying Zhang, Vivien Béziat, Richard P. Lifton, Paul Bastard, Luigi D. Notarangelo, Laurent Abel, Helen C. Su, Emmanuelle Jouanguy, Ali Amara, Vassili Soumelis, Aurélie Cobat, Qian Zhang, Jean‐Laurent Casanova

Notice bibliographique

RevueScience Immunology · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueRespiratory viral infections research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNHLBI Division of Intramural ResearchNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesUniversité Claude Bernard Lyon 1Agencia Estatal de InvestigaciónInstituto de Salud Carlos IIIQatar National Research FundUniformed Services University of the Health SciencesUniversity of California, Los AngelesNational Institutes of HealthUniversité de ParisCenter for Innovative MedicineSorbonne UniversitéInstituto Colombiano de Crédito Educativo y Estudios Técnicos en el ExteriorAgence Nationale de la RechercheUniversität InnsbruckLékařská fakulta, Masarykova univerzitaUniverzita Karlova v PrazeMinisterio de Ciencia e InnovaciónUniversitat Autònoma de BarcelonaUniversité de LyonRegione LazioMansoura UniversityMedical Research CouncilTartu ÜlikoolUniversità degli Studi di BresciaCentral European Institute of TechnologyFondation du SouffleCentre Hospitalier Universitaire VaudoisUniversité de LausanneInstituto Tecnológico y de Energías RenovablesGöteborgs UniversitetUniversidade de São PauloScience for Life LaboratoryUniversidad de AntioquiaHospices Civils de LyonMedizinische Universität InnsbruckCentre National de la Recherche ScientifiqueFonds National de la Recherche LuxembourgMinistero della SaluteSidra MedicineInstitut National de la Santé et de la Recherche MédicaleUniversiteit GentFederal Aviation AdministrationInvitaeImperial College LondonNorthwell HealthInstitut des maladies génétiques ImagineUniversitair Ziekenhuis GentInstituto Nacional de PediatriaBC Children's HospitalLeidosTel Aviv UniversityUniversidad de La LagunaMasarykova UniverzitaDepartamento Administrativo de Ciencia, Tecnología e Innovación (COLCIENCIAS)Frederick National Laboratory for Cancer ResearchGenentechMurdoch Children's Research InstituteEuropean CommissionHelsingin YliopistoChildren's Healthcare of AtlantaNational Human Genome Research InstituteAarhus UniversitetshospitalAarhus UniversitetHarvard UniversityDivision of Intramural Research, National Institute of Allergy and Infectious DiseasesStockholms Läns LandstingUniversity of New South WalesKU LeuvenFondation pour la Recherche MédicaleInstitució Catalana de Recerca i Estudis AvançatsCliniques Universitaires Saint-LucEmory UniversityChildren’s Hospital of Wisconsin Research InstituteNational Center for Advancing Translational SciencesMercatus Center, George Mason UniversityJPB FoundationAssistance publique-Hôpitaux de ParisUniversità degli Studi di Milano-BicoccaInstitut Gustave-RoussyUniversité de BourgogneUniversity of PennsylvaniaFisher Center for Alzheimer's Research FoundationLudwig Institute for Cancer ResearchSahlgrenska AkademinHenry M. Jackson FoundationFondation Bettencourt SchuellerSt. Giles FoundationUniversidad de NavarraGeorge Mason UniversityKaradeniz Teknik ÜniversitesiKarolinska InstitutetYale UniversityUniversité Hassan II de CasablancaGilead SciencesBrigham and Women's HospitalGeorgia Clinical and Translational Science AllianceHoward Hughes Medical Institute
Mots-clésTLR7PneumoniaImmunologyAsymptomaticCohortBiologyPopulationMedicineInternal medicineGastroenterologyImmune systemInnate immune systemToll-like receptor

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The patients' blood plasmacytoid dendritic cells (pDCs) produce low levels of type I IFNs in response to SARS-CoV-2. Overall, X-linked recessive TLR7 deficiency is a highly penetrant genetic etiology of critical COVID-19 pneumonia, in about 1.8% of male patients below the age of 60 years. Human TLR7 and pDCs are essential for protective type I IFN immunity against SARS-CoV-2 in the respiratory tract.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,015

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0050,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,064
Tête enseignante GPT0,394
Écart entre enseignants0,330 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations420
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueScience ImmunologyMême sujetRespiratory viral infections researchTravaux en français237 207