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Enregistrement W3193450770 · doi:10.1371/journal.ppat.1009825

Increased homeostatic cytokines and stability of HIV-infected memory CD4 T-cells identify individuals with suboptimal CD4 T-cell recovery on-ART

2021· article· en· W3193450770 sur OpenAlexaff
María Pino, Susan Pereira Ribeiro, Amélie Pagliuzza, Khader Ghneim, Anum N. Khan, Emily S. Ryan, Justin Harper, Colin T. King, Sarah Welbourn, Luca Micci, Sol Aldrete, Keith A. Delman, Theron Stuart, Michael Lowe, Jason M. Brenchley, Cynthia A. Derdeyn, Kirk A. Easley, Rafick‐Pierre Sékaly, Nicolas Chomont, Mirko Paiardini, Vincent C. Marconi

Notice bibliographique

RevuePLoS Pathogens · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueHIV Research and Treatment
Établissements canadiensCentre Hospitalier de l’Université de Montréal
Organismes subventionnairesNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesEli Lilly and CompanyEmory UniversityCenter for AIDS Research, Emory UniversityNational Institutes of HealthGilead Sciences
Mots-clésTIGITHomeostasisImmunologyT cellCellCd4 t cellAntiretroviral therapyMemory T cellImmune systemMedicineViral loadChemistryHuman immunodeficiency virus (HIV)BiologyCell biologyBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Clinical outcomes are inferior for individuals with HIV having suboptimal CD4 T-cell recovery during antiretroviral therapy (ART). We investigated if the levels of infection and the response to homeostatic cytokines of CD4 T-cell subsets contributed to divergent CD4 T-cell recovery and HIV reservoir during ART by studying virologically-suppressed immunologic responders (IR, achieving a CD4 cell count >500 cells/μL on or before two years after ART initiation), and virologically-suppressed suboptimal responders (ISR, did not achieve a CD4 cell count >500 cells/μL in the first two years after ART initiation). Compared to IR, ISR demonstrated higher levels of HIV-DNA in naïve, central (CM), transitional (TM), and effector (EM) memory CD4 T-cells in blood, both pre- and on-ART, and specifically in CM CD4 T-cells in LN on-ART. Furthermore, ISR had higher pre-ART plasma levels of IL-7 and IL-15, cytokines regulating T-cell homeostasis. Notably, pre-ART PD-1 and TIGIT expression levels were higher in blood CM and TM CD4 T-cells for ISR; this was associated with a significantly lower fold-changes in HIV-DNA levels between pre- and on-ART time points exclusively on CM and TM T-cell subsets, but not naïve or EM T-cells. Finally, the frequency of CM CD4 T-cells expressing PD-1 or TIGIT pre-ART as well as plasma levels of IL-7 and IL-15 predicted HIV-DNA content on-ART. Our results establish the association between infection, T-cell homeostasis, and expression of PD-1 and TIGIT in long-lived CD4 T-cell subsets prior to ART with CD4 T-cell recovery and HIV persistence on-ART.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,028
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,234
Écart entre enseignants0,218 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations29
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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