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Enregistrement W3193567675 · doi:10.1038/s41467-021-25167-5

Two doses of SARS-CoV-2 vaccination induce robust immune responses to emerging SARS-CoV-2 variants of concern

2021· article· en· W3193567675 sur OpenAlexfundno aff
Donal Skelly, Adam Harding, Javier Gilbert‐Jaramillo, Michael L. Knight, Stéphanie Longet, Anthony Brown, Sandra Adele, Emily Adland, Helen Brown, Senthil Chinnakannan, Timothy Donnison, Mohammad Ali, Patpong Rongkard, Matthew Pace, Peny Zacharopoulou, Nicola Robinson, Anna Csala, Cathy De Lara, Claire Hutchings, Hema Mehta, Lian Ni Lee, Matthew Edmans, Carl-Philipp Hackstein, Prabhjeet Phalora, Wenqin Li, Eloise Phillips, Tom Malone, Ane Ogbe, Cecilia Jay, Timothy Tipoe, Tom Tipton, Lizzie Stafford, Alexander J. Mentzer, Síle A. Johnson, Ali Amini, Thomas Marjot, Stavros Dimitriadis, Beatrice Simmons, Alexandra Deeks, Sven Kerneis, Hibatullah Abuelgasim, Robert Wilson, Sarah Thomas, Adam Watson, Ahmed Alhussni, Joseph Cutteridge, Esme Weeks, Lucy Denly, Katy Lillie, Jennifer Holmes, Philippa C. Matthews, Denise O’Donnell, Tiong Kit Tan, Lisa Schimanski, Kuan-Ying A. Huang, Pramila Rijal, Lance Turtle, Thushan I. de Silva, Alex Richter, C.J. Duncan, Rebecca Payne, Shona C. Moore, Julian C. Knight, Mark Philip Cassar, Betty Raman, Stefan Neubauer, Anastasia Fries, Nick P. Talbot, Nayia Petousi, Ling‐Pei Ho, Yanchun Peng, Tao Dong, Susana Camara, Spyridoula Marinou, Aline Linder, Syed Adlou, Mwila Kasanyinga, Alice Bridges-Webb, Jennifer Hill, Laura Silva-Reyes, Luke Blackwell, John Frater, Philip Goulder, Christopher P. Conlon, Katie Jeffery, Christina Dold, Andrew J. Pollard, Alex Sigal, Túlio de Oliveira, Alain Townsend, Paul Klenerman, Susanna Dunachie, Eleanor Barnes, Miles W. Carroll, William James

Notice bibliographique

RevueNature Communications · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueSARS-CoV-2 and COVID-19 Research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesMedical Research CouncilNational Institutes of HealthHamilton Health Sciences FoundationUniversity of OxfordPublic Health EnglandDepartment of Health and Social CareNational Institute for Health and Care ResearchNational Institute for Health Research Health Protection Research UnitUniversity of New South WalesBritish Heart FoundationNIHR Oxford Biomedical Research CentreWellcome TrustBiotechnology and Biological Sciences Research CouncilHuo Family FoundationUK Research and InnovationUK Coronavirus Immunology ConsortiumMeso Scale Diagnostics
Mots-clésSevere acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2)Coronavirus disease 2019 (COVID-19)2019-20 coronavirus outbreakSars virusVaccinationVirologyImmune systemBetacoronavirusMedicineCoronavirus InfectionsPandemicImmunologyOutbreakInfectious disease (medical specialty)Disease

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The extent to which immune responses to natural infection with severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) and immunization with vaccines protect against variants of concern (VOC) is of increasing importance. Accordingly, here we analyse antibodies and T cells of a recently vaccinated, UK cohort, alongside those recovering from natural infection in early 2020. We show that neutralization of the VOC compared to a reference isolate of the original circulating lineage, B, is reduced: more profoundly against B.1.351 than for B.1.1.7, and in responses to infection or a single dose of vaccine than to a second dose of vaccine. Importantly, high magnitude T cell responses are generated after two vaccine doses, with the majority of the T cell response directed against epitopes that are conserved between the prototype isolate B and the VOC. Vaccination is required to generate high potency immune responses to protect against these and other emergent variants.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,004
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,055
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,004
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,002
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,127
Tête enseignante GPT0,439
Écart entre enseignants0,312 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations191
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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