Epigenetic age is associated with baseline and 3-year change in frailty in the Canadian Longitudinal Study on Aging
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: The trajectory of frailty in older adults is important to public health; therefore, markers that may help predict this and other important outcomes could be beneficial. Epigenetic clocks have been developed and are associated with various health-related outcomes and sociodemographic factors, but associations with frailty are poorly described. Further, it is uncertain whether newer generations of epigenetic clocks, trained on variables other than chronological age, would be more strongly associated with frailty than earlier developed clocks. Using data from the Canadian Longitudinal Study on Aging (CLSA), we tested the hypothesis that clocks trained on phenotypic markers of health or mortality (i.e., Dunedin PoAm, GrimAge, PhenoAge and Zhang in Nat Commun 8:14617, 2017) would best predict changes in a 76-item frailty index (FI) over a 3-year interval, as compared to clocks trained on chronological age (i.e., Hannum in Mol Cell 49:359-367, 2013, Horvath in Genome Biol 14:R115, 2013, Lin in Aging 8:394-401, 2016, and Yang Genome Biol 17:205, 2016). RESULTS: We show that in 1446 participants, phenotype/mortality-trained clocks outperformed age-trained clocks with regard to the association with baseline frailty (mean = 0.141, SD = 0.075), the greatest of which is GrimAge, where a 1-SD increase in ΔGrimAge (i.e., the difference from chronological age) was associated with a 0.020 increase in frailty (95% CI 0.016, 0.024), or ~ 27% relative to the SD in frailty. Only GrimAge and Hannum (Mol Cell 49:359-367, 2013) were significantly associated with change in frailty over time, where a 1-SD increase in ΔGrimAge and ΔHannum 2013 was associated with a 0.0030 (95% CI 0.0007, 0.0050) and 0.0028 (95% CI 0.0007, 0.0050) increase over 3 years, respectively, or ~ 7% relative to the SD in frailty change. CONCLUSION: Both prevalence and change in frailty are associated with increased epigenetic age. However, not all clocks are equally sensitive to these outcomes and depend on their underlying relationship with chronological age, healthspan and lifespan. Certain clocks were significantly associated with relatively short-term changes in frailty, thereby supporting their utility in initiatives and interventions to promote healthy aging.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,005 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,002 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».