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Enregistrement W3193967810 · doi:10.48336/g6k6-7244

Genomic and functional analyses of Newfoundland and Labrador families with intracranial aneurysms

2021· dissertation· en· W3193967810 sur OpenAlexafffundabout
Julia J. Pennell

Notice bibliographique

RevueMemorial University Research Repository (Memorial University) · 2021
Typedissertation
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueIntracranial Aneurysms: Treatment and Complications
Établissements canadiensMemorial University of Newfoundland
Organismes subventionnairesHeart and Stroke Foundation of Canada
Mots-clésSanger sequencingZebrafishMorpholinoBiologyDanioPhenotypeExome sequencingGeneticsCandidate geneGeneExomePopulationGene knockdownMutantBioinformaticsMutationMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The integrity of an arterial wall is impacted by various genetic, environmental, and physiological factors that predispose to intracranial aneurysm (IA) formation in certain individuals. In this study, whole exome sequencing was completed on a large cohort of families from the Newfoundland and Labrador population to identify genetic predispositions contributing to IA development. With the use of Sanger sequencing, HAL (c.959C>T; p.T320M) emerged as a favourable candidate variant, and morpholino mediated gene knockdown of hal in Danio rerio (zebrafish) demonstrated a dose-dependent hemorrhagic phenotype. The re-expression of wildtype HAL RNA in the hal morpholino background was able to rescue the hemorrhagic phenotype while mutant HAL RNA was not. These results suggest that the HAL (c.959C>T; p.T320M) variant could be contributing to IA development in Family R1262. Additional analysis of the HAL gene could help determine the extent of its involvement and contribute to an improved understanding of IA pathogenesis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,607
Score d'incertitude au seuil0,782

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0020,002
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,031
Tête enseignante GPT0,274
Écart entre enseignants0,243 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2021
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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