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Enregistrement W3194361883

Structure et fonctionnement des communautés microbiennes dans la glace annuelle et pluriannuelle de la mer de Lincoln au printemps

2020· article· fr· W3194361883 sur OpenAlexaboutno aff
Constance Duffaud

Notice bibliographique

RevueSémaphore (Université du Québec à Rimouski) · 2020
Typearticle
Languefr
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueMarine Bivalve and Aquaculture Studies
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésForestryGeography
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

RÉSUMÉ: La glace de mer est un écosystème unique au sein des régions polaires qui constitue un habitat pour une communauté de microorganismes diversifiée, active et spécialisée associée à la glace. La diminution de l'étendue et de l'épaisseur de glace de mer dans l'océan Arctique et le remplacement progressif de la glace pluriannuelle par la glace annuelle modifient l'habitat des communautés microbiennes présentes dans la glace de mer. Dans ce contexte de changement climatique et en raison de leur rôle central dans les cycles biogéochimiques des milieux marins, il est essentiel de caractériser la dynamique microbienne dans la glace de mer. Dans cette étude, nous évaluons la structure et le fonctionnement des communautés microbiennes dans la glace de mer annuelle et pluriannuelle de la mer de Lincoln en déterminant la répartition des bactéries et des virus ainsi que leur relation avec les facteurs biotiques et abiotiques. Nos résultats révèlent de forts gradients verticaux dans la répartition verticale des bactéries et des virus dans la glace de mer où les abondances sont plus élevées à la base de la glace. De plus, la répartition verticale des bactéries et des virus est similaire à celle des nutriments, du carbone organique dissous (COD) et de la chlorophylle a (chl a). Des relations significatives et positives entre l'abondance des bactéries et des virus et le phosphate, le COD, la chl a et le volume de saumure (un indice de la perméabilité de la glace) ont été mises en évidence pour la glace de mer annuelle et pluriannuelle en période printanière. Un modèle écologique basé sur l'analyse des coefficients de direction a révélé un réseau trophique microbien dans la glace de mer du Haut-Arctique canadien et un couplage étroit entre les bactéries et les algues via le COD et le phosphate. La même analyse souligne que les virus dans la glace de mer sont essentiellement bactériophages. Ce projet fournit de nouvelles connaissances sur la structure et le fonctionnement des microorganismes dans la glace annuelle et pluriannuelle de la mer de Lincoln, une région unique où la glace pluriannuelle devrait persister au cours des prochaines décennies. -- Mot(s) clé(s) en français : Glace de mer, bactéries, virus, répartition verticale, réseau microbien, mer de Lincoln, zone séculaire de glace, Haut-Arctique canadien. -- ABSTRACT: Sea ice is a unique ecosystem within the polar regions and constitutes a habitat for a diverse, active and specialized ice-associated community of microorganisms. The decline in sea ice extent and thickness in the Arctic Ocean and the gradual replacement of multiyear ice by first-year ice significantly alters the habitat of sea-ice microbial communities. In this context of climate change and due to their central role in biogeochemical cycles in marine systems, it is essential to characterize the dynamics of sea-ice microbes. In this study, we assess the structure and function of microbial communities in first-year and multiyear ice in the Lincoln Sea by determining the distribution of bacteria and viruses and their relationships with biotic and abiotic variables. Our results show strong vertical gradients in the distribution of bacteria and viruses in the ice, with higher bacterial and viral abundances at the bottom ice horizon. The vertical distribution of bacteria and viruses in the ice was closely related to that of nutrients, dissolved organic carbon (DOC) and chlorophyll a (chl a). Significant and positive relationships were found between bacterial and viral abundances and phosphate, DOC, chl a and brine volume (a proxy of sea ice permeability) in first-year and multiyear ice during spring. Ecological modelling through path analysis reveals an active microbial food web in the sea ice of the Canadian High Arctic and a tight coupling between bacteria and sea ice algae via DOC and phosphate. The same analysis highlights that viruses in sea ice are likely bacteriophages. This study provides new knowledge on the structure and functioning of microorganisms in first-year and multiyear ice in the Lincoln Sea, a unique region where multiyear ice is predicted to persist over the next decades. -- Mot(s) clé(s) en anglais : Sea ice, bacteria, viruses, vertical distribution, microbial food web, Lincoln Sea, Last Ice, Canadian High Arctic.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,019
Score d'incertitude au seuil0,038

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,209
Écart entre enseignants0,202 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2020
Routes d'admission1
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