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Enregistrement W3194675136 · doi:10.5376/bm.2021.12.0005

Expression Analysis of miR393 and Target Gene <i>Ve</i> of <i>Solanum torvum</i> Swartz Infected by <i>Verticillium dahliae</i> Kleb

2021· article· en· W3194675136 sur OpenAlexvenueno aff
Yalong Qin, Zhanhui Jia, Zhong Wang, Xiaochun Shu, Weibing Zhuang, Peng Feng

Notice bibliographique

RevueBioscience Methods · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant-Microbe Interactions and Immunity
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyVerticillium dahliaeGeneGeneticsBotany

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

In this study, Solanum torvum Swartz. was used as material and B-Actin gene and U6 were used as internal references. First, the expression characteristics analysis of miR393 and target gene Ve were performed on the root, stem, leaf, flower and fruit of Solanum torvum Swartz. during flowering and fruiting stage. The strong Verticillium dahliae Kleb. were inoculated into Solanum torvum Swartz. during 5-6 leaf stage, and the control group was treated with ultrapure water. The Solanum torvum Swartz. roots were taken at 0 h, 3 h, 6 h, 12 h, 24 h, 36 h, 48 h and 72 h for expression analysis of infection by Verticillium dahliae Kleb.. The results showed that under normal growth conditions, miR393 and target gene Ve had specific expression patterns in different tissues of Solanum torvum Swartz., and the differential expression was significant. Both miR393 and target gene Ve had the highest expression levels in roots, followed by stems, and had the lowest levels in fruits. After infection by Verticillium dahliae Kleb., both miR393 and target gene Ve had certain expression in different infection periods. The expression of target gene Ve showed an upward tendency with the extension of infection time, and the highest expression level appeared at 48 h, followed by 72 h. While the expression of miR393 showed a downward tendency with the extension of infection time, and the highest expression level appeared at 6 h. The expression of miR393 and target gene Ve showed opposite tendencies in different infection periods. These results provided a foundation for further research on the interaction mechanism between miR393 and target gene Ve and the molecular mechanism of resistance to Verticillium wilt.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,023
Tête enseignante GPT0,281
Écart entre enseignants0,258 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2021
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Résumé présentoui

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