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Enregistrement W3194760139 · doi:10.1038/s41597-021-00941-8

Open-access quantitative MRI data of the spinal cord and reproducibility across participants, sites and manufacturers

2021· article· en· W3194760139 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevueScientific Data · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAdvanced Neuroimaging Techniques and Applications
Établissements canadiensPhilips (Canada)McGill UniversityCentre Hospitalier Universitaire de SherbrookeInternational Collaboration On Repair DiscoveriesUniversity of British ColumbiaUniversité de MontréalUniversité de SherbrookeCentre Hospitalier Universitaire Sainte-JustinePolytechnique MontréalMontreal Neurological Institute and HospitalMila - Quebec Artificial Intelligence Institute
Organismes subventionnairesNational Institute of Neurological Disorders and StrokeStaatssekretariat für Bildung, Forschung und InnovationEconomic and Social Research CouncilEngineering and Physical Sciences Research CouncilNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaNational Institute of Biomedical Imaging and BioengineeringCanadian Institutes of Health ResearchCRIS Cancer FoundationRegione PugliaUniversity College London Hospitals NHS Foundation TrustMinistero dell’Istruzione, dell’Università e della RicercaMinistero della SaluteConcordia UniversityAgentura Pro Zdravotnický Výzkum České RepublikyNational Institutes of HealthRosetrees TrustEuropean CommissionMultiple Sclerosis SocietyBundesministerium für Bildung und ForschungNational Imaging FacilityNational Institute for Health and Care ResearchUniversity of PennsylvaniaSpinalCure AustraliaUniversity of MinnesotaNational Science FoundationCompute CanadaSchweizerischer Nationalfonds zur Förderung der Wissenschaftlichen ForschungPolytechnique MontréalWellcome TrustInstitut de Valorisation des DonnéesAstraZenecaCraig H. Neilsen FoundationMcGill UniversityCanada First Research Excellence FundMax-Planck-Gesellschaft
Mots-clésProtocol (science)ReproducibilityComputer scienceSpinal cordDocumentationData miningMedicineStatisticsMathematicsPathology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

In a companion paper by Cohen-Adad et al. we introduce the spine generic quantitative MRI protocol that provides valuable metrics for assessing spinal cord macrostructural and microstructural integrity. This protocol was used to acquire a single subject dataset across 19 centers and a multi-subject dataset across 42 centers (for a total of 260 participants), spanning the three main MRI manufacturers: GE, Philips and Siemens. Both datasets are publicly available via git-annex. Data were analysed using the Spinal Cord Toolbox to produce normative values as well as inter/intra-site and inter/intra-manufacturer statistics. Reproducibility for the spine generic protocol was high across sites and manufacturers, with an average inter-site coefficient of variation of less than 5% for all the metrics. Full documentation and results can be found at https://spine-generic.rtfd.io/ . The datasets and analysis pipeline will help pave the way towards accessible and reproducible quantitative MRI in the spinal cord.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Étiquettes directes de modèles (non validées)

Étiquettes de catégorie et de devis d'étude par modèle, issues des rondes d'étiquetage. C'est une sortie machine, non validée, et le désaccord entre modèles est livré comme donnée. Aucun devis ici n'est encore validé contre MEDLINE.

BrasCatégoriesDevis d'étudeConfiance
gemmaMétarechercheScience ouverte
Domaine: Reproductibilité · Genre: Empirique
Porte sur le système de recherche canadien: non · Porte sur un sujet canadien: non
Observationnelhigh
gptMétarechercheScience ouverte
Domaine: Reproductibilité · Genre: Jeu de données
Porte sur le système de recherche canadien: non · Porte sur un sujet canadien: non
Sans objethigh
modèles en désaccordL'accord compare des ensembles de catégories et des devis identiques entre les bras.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesScience ouverte
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,348
Score d'incertitude au seuil0,993

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,001
Science ouverte0,0020,015
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,625
Tête enseignante GPT0,577
Écart entre enseignants0,048 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle