CRISPR/dCas9-Mediated Inhibition of Replication of Begomoviruses
Notice bibliographique
Résumé
<ns2:p>CRISPR/Cas9 system with deactivated or dead nuclease domain of Cas9 (known as dCas9) can also be used as a DNA binding protein to target specific DNA sequences. Similar to zinc fingers and transcription activator like effectors (TALEs), dCas9 can be fused with other effector domains for different purposes such as gene activation, gene repression, modification of epigenetic marks etc. Previously, TALEs were used to target and occupy the most conserved nonanucleotide sequence of Cotton Leaf Curl Virus (CLCuV) with promising results. The purpose of this study is to check the efficiency of dCas9 as DNA binding protein targeting the nonanucleotide sequence of CLCuV to inhibit virus replication. Nicotiana benthamiana was used to evaluate the efficiency of CRISPR/dCas9 system for viral interference. The resistance against virus infection and suppression of replication of the virus was assessed by PCR, RT-PCR and symptoms development on plant leaves in terms of days’ post inoculation (dpi). Expression of the Cas9 and gRNA was quantified using RT-PCR. The results showed partial inhibition of CLCuV replication, lower disease symptoms and virus accumulation as compared to control plants. A comparison of current and previous results using TALEs showed that dCas9 was slightly less efficient to suppress virus replication. Multiplexing of gene editing techniques could be the way forward to engineer virus resistance in plants.</ns2:p>
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».