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Enregistrement W3195526608 · doi:10.1371/journal.ppat.1009824

pUL21 is a viral phosphatase adaptor that promotes herpes simplex virus replication and spread

2021· article· en· W3195526608 sur OpenAlexfundno aff
Tomasz H. Benedyk, Julia Muenzner, Viv Connor, Yue Han, Katherine A. Brown, Kaveesha J. Wijesinghe, Yunhui Zhuang, Susanna Colaco, Guido A. Stoll, Owen S. Tutt, Stanislava Svobodova, Dmitri I. Svergun, Neil A. Bryant, Janet E. Deane, Andrew E. Firth, Cy M. Jeffries, Colin M. Crump, Stephen C. Graham

Notice bibliographique

RevuePLoS Pathogens · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueHerpesvirus Infections and Treatments
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesBiotechnology and Biological Sciences Research CouncilDirectorate for Biological SciencesQueen's UniversityUniversity of BristolUniversity of GlasgowWellcome TrustUniversity of PennsylvaniaFrancis Crick InstituteNational Institute for Health and Care ResearchMedical Research CouncilRoyal SocietyWellcome
Mots-clésHerpes simplex virusSignal transducing adaptor proteinBiologyViral replicationVirusVirologyDephosphorylationCell biologyProtein phosphatase 1PhosphataseSingle-stranded binding proteinPhosphorylationGeneticsDNA-binding proteinGeneTranscription factor

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The herpes simplex virus (HSV)-1 protein pUL21 is essential for efficient virus replication and dissemination. While pUL21 has been shown to promote multiple steps of virus assembly and spread, the molecular basis of its function remained unclear. Here we identify that pUL21 is a virus-encoded adaptor of protein phosphatase 1 (PP1). pUL21 directs the dephosphorylation of cellular and virus proteins, including components of the viral nuclear egress complex, and we define a conserved non-canonical linear motif in pUL21 that is essential for PP1 recruitment. In vitro evolution experiments reveal that pUL21 antagonises the activity of the virus-encoded kinase pUS3, with growth and spread of pUL21 PP1-binding mutant viruses being restored in adapted strains where pUS3 activity is disrupted. This study shows that virus-directed phosphatase activity is essential for efficient herpesvirus assembly and spread, highlighting the fine balance between kinase and phosphatase activity required for optimal virus replication.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,778
Score d'incertitude au seuil0,621

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,044
Tête enseignante GPT0,292
Écart entre enseignants0,248 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations36
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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