Isolation of rhizobacteria in Southwestern Québec, Canada: An investigation of their impact on the growth and salinity stress alleviation in Arabidopsis thaliana and crop plants
Notice bibliographique
Résumé
Dans la mesure où aucune analyse holistique n’avait été faite jusqu’alors sur la diversité des rhizobactéries établies dans les espaces sauvages et agricoles du Sud-Ouest du Québec, le premier objectif de ce projet était d’identifier les communautés rhizobactériennes cultivables associées à différents types de plantes sauvages et cultivées de la région de Sainte-Anne-de-Bellevue. Un total de 446 souches de rhizobactéries ont été isolées et classées en 90 genres bactériens, les phyla dominants dans tous les échantillons étant Proteobacteria, Actinobacteria, Firmicutes et Bacteroidetes.Leur capacité à promouvoir la croissance a été évaluée en utilisant l’écotype Columbia (Col-0) d’Arabidopsis thaliana. Quatre des 98 souches rhizobactériennes ainsi sélectionnées (souches n, L, K et Y), initialement associées à Phalaris arundinacea, Solanum dulcamara, Scorzoneroides autumnalis et Glycine max, respectivement, ont montré des effets significatifs sur la stimulation de la croissance, plus précisément en termes de surface foliaire totale et de poids sec, de longueur des racines et de capacité antioxydante totale, de capacité d’atténuation de la salinité et de teneur totale en proline et en chlorophylle. Les souches n et L ont également présenté, in vitro et in planta, des effets antagonistes contre deux phytopathogènes. Le traitement bactérien a provoqué une augmentation de la transcription des gènes liés à la croissance, à l’accumulation d’osmolytes, à la réponse immunitaire et aux activités antioxydantes. La capacité des quatre souches sélectionnées à favoriser la croissance des plantes a également été caractérisée en culture pure. Étonnamment, la souche K n’a pas présenté une grande capacité à promouvoir la croissance in vitro, mais a surpassé la souche n in planta, malgré le fait que cette dernière était celle qui accumulait le plus de traits associés à la promotion de la croissance.Deuxièmement, les quatre souches sélectionnées ont été testées sur deux plantes cultivées, Brassica napus (le canola) et Zea mays (le maïs), pour leurs effets sur la promotion de la croissance et la réduction du stress salin. Dans les tests sur la germination et la croissance précoce des semis, les quatre souches, et en particulier L, K et Y, ont entraîné une augmentation de la longueur des racines et du poids sec des plantules du canola à la fois en absence et en présence de salinité. Les quatre souches ont aussi significativement amélioré la longueur des plantules (jusqu’à 33%) et le poids frais (jusqu’à 25%) du maïs en absence de stress. Dans les expériences en pot, la biomasse des plantes de canola et leur teneur en chlorophylle ont été augmentées par les quatre souches évaluées dans des conditions stériles. De même, la biomasse des plants de maïs et leur teneur en chlorophylle ont présenté un accroissement significatif avec toutes les souches dans des conditions non stériles en serre. Seules les souches n et L ont augmenté les teneurs totales en antioxydants et en proline, tandis que les souches L, K et Y ont augmenté la teneur totale en glucides dans la plante. L’absorption des nutriments a également été évaluée, avec des niveaux plus élevés d’absorption de fer et de phosphore dans les feuilles de maïs des plantes inoculées avec la souche n, et une teneur en azote accrue après le traitement par les souches n, L et Y.Dans l’ensemble, cette recherche (1) a mis en évidence, pour la première fois, la richesse du réservoir des diverses rhizobactéries associées aux plantes cultivées et non cultivées de la région de Sainte-Anne-de-Bellevue, Québec, Canada, (2) a démontré que quatre isolats sur 98 ont significativement augmenté la croissance et la résistance au stress salin chez A. thaliana, (3) a montré que les mêmes quatre souches ont amélioré également la croissance de deux plantes cultivées testées, le canola et le maïs, dans des conditions stériles et non stériles
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,002 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
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score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».