Isolation of rhizobacteria in Southwestern Québec, Canada: An investigation of their impact on the growth and salinity stress alleviation in Arabidopsis thaliana and crop plants
Bibliographic record
Abstract
Dans la mesure où aucune analyse holistique n’avait été faite jusqu’alors sur la diversité des rhizobactéries établies dans les espaces sauvages et agricoles du Sud-Ouest du Québec, le premier objectif de ce projet était d’identifier les communautés rhizobactériennes cultivables associées à différents types de plantes sauvages et cultivées de la région de Sainte-Anne-de-Bellevue. Un total de 446 souches de rhizobactéries ont été isolées et classées en 90 genres bactériens, les phyla dominants dans tous les échantillons étant Proteobacteria, Actinobacteria, Firmicutes et Bacteroidetes.Leur capacité à promouvoir la croissance a été évaluée en utilisant l’écotype Columbia (Col-0) d’Arabidopsis thaliana. Quatre des 98 souches rhizobactériennes ainsi sélectionnées (souches n, L, K et Y), initialement associées à Phalaris arundinacea, Solanum dulcamara, Scorzoneroides autumnalis et Glycine max, respectivement, ont montré des effets significatifs sur la stimulation de la croissance, plus précisément en termes de surface foliaire totale et de poids sec, de longueur des racines et de capacité antioxydante totale, de capacité d’atténuation de la salinité et de teneur totale en proline et en chlorophylle. Les souches n et L ont également présenté, in vitro et in planta, des effets antagonistes contre deux phytopathogènes. Le traitement bactérien a provoqué une augmentation de la transcription des gènes liés à la croissance, à l’accumulation d’osmolytes, à la réponse immunitaire et aux activités antioxydantes. La capacité des quatre souches sélectionnées à favoriser la croissance des plantes a également été caractérisée en culture pure. Étonnamment, la souche K n’a pas présenté une grande capacité à promouvoir la croissance in vitro, mais a surpassé la souche n in planta, malgré le fait que cette dernière était celle qui accumulait le plus de traits associés à la promotion de la croissance.Deuxièmement, les quatre souches sélectionnées ont été testées sur deux plantes cultivées, Brassica napus (le canola) et Zea mays (le maïs), pour leurs effets sur la promotion de la croissance et la réduction du stress salin. Dans les tests sur la germination et la croissance précoce des semis, les quatre souches, et en particulier L, K et Y, ont entraîné une augmentation de la longueur des racines et du poids sec des plantules du canola à la fois en absence et en présence de salinité. Les quatre souches ont aussi significativement amélioré la longueur des plantules (jusqu’à 33%) et le poids frais (jusqu’à 25%) du maïs en absence de stress. Dans les expériences en pot, la biomasse des plantes de canola et leur teneur en chlorophylle ont été augmentées par les quatre souches évaluées dans des conditions stériles. De même, la biomasse des plants de maïs et leur teneur en chlorophylle ont présenté un accroissement significatif avec toutes les souches dans des conditions non stériles en serre. Seules les souches n et L ont augmenté les teneurs totales en antioxydants et en proline, tandis que les souches L, K et Y ont augmenté la teneur totale en glucides dans la plante. L’absorption des nutriments a également été évaluée, avec des niveaux plus élevés d’absorption de fer et de phosphore dans les feuilles de maïs des plantes inoculées avec la souche n, et une teneur en azote accrue après le traitement par les souches n, L et Y.Dans l’ensemble, cette recherche (1) a mis en évidence, pour la première fois, la richesse du réservoir des diverses rhizobactéries associées aux plantes cultivées et non cultivées de la région de Sainte-Anne-de-Bellevue, Québec, Canada, (2) a démontré que quatre isolats sur 98 ont significativement augmenté la croissance et la résistance au stress salin chez A. thaliana, (3) a montré que les mêmes quatre souches ont amélioré également la croissance de deux plantes cultivées testées, le canola et le maïs, dans des conditions stériles et non stériles
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How this classification was reachedexpand
Full frame machine prediction
Teacher imitationNot calibrated prevalence, not ground truth. Human validation pending. The Gemma side is a direct model label for every work in the frame, read from the title-only record. The Codex side is a classifier learned from the 10,348 direct Codex labels and calibrated to design-weighted sample rates; fields without enough sample support carry no Codex call. Candidate is the union of the two sides; consensus is their intersection. These outputs are machine_predicted_unvalidated and are not human labels.
Distilled classifier scores by category (both heads)
| Category | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Metaresearch | 0.000 | 0.000 |
| Meta-epidemiology (narrow) | 0.000 | 0.000 |
| Meta-epidemiology (broad) | 0.000 | 0.000 |
| Bibliometrics | 0.001 | 0.001 |
| Science and technology studies | 0.002 | 0.000 |
| Scholarly communication | 0.001 | 0.000 |
| Open science | 0.000 | 0.000 |
| Research integrity | 0.000 | 0.000 |
| Insufficient payload (model declined to judge) | 0.001 | 0.000 |
Machine scores (provisional)
The two teacher heads of the student model, read on this work. A score orders the frame for review; it never asserts a category, and the validation status ships verbatim with every row.
Baseline scores from an immature model (maturity gate not passed, 7 training rounds). Scores rank; they never assert a category.
score_only:v0-immature-baseline · verbatim from the scoring run: score_only means the number may rank works, and no category label ships from itClassification
machine, unvalidatedMachine predicted; a candidate call from one source (direct Gemma or distilled Codex), not a consensus.
How this classification was reached, model by model and score by score, is at the end of the page under "How this classification was reached".