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Enregistrement W3195921899 · doi:10.1289/isee.2021.p-168

Associations of urinary microbiome profiles with gestational diabetes mellitus in an Oklahoma case-control study

2021· article· en· W3195921899 sur OpenAlexaff
Wei‐Jen Chen, Candace Robledo, Erin M. Davis, Cecil M. Lewis, Krithivasan Sankaranarayanan, Hélène Carabin, Michael P. Anderson, LaTasha B. Craig, Jean R. Goodman, Jennifer D. Peck

Notice bibliographique

RevueISEE Conference Abstracts · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueUrinary Tract Infections Management
Établissements canadiensUniversité de Montréal
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMicrobiomeGestational diabetesBiologyOdds ratioPhysiologyRelative species abundanceCase-control studyInternal medicineMedicinePregnancyObstetricsEcologyBioinformaticsGestationAbundance (ecology)Genetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND AND AIM: Previous research has demonstrated associations between the human placental, gut, and vaginal microbiome and gestational diabetes mellitus (GDM). Recent findings suggest urine is a biomarker for integrated profiling of the genitourinary and amniotic microbiome. However, little is known about how urinary microbiome disturbances may relate to GDM. The present study aims to characterize and compare the urinary microbial profiles among pregnant women with and without GDM. METHODS: Bacterial DNA was extracted from mid-pregnancy urine obtained from a prevalence case-control study of 59 GDM cases and 206 controls from the University of Oklahoma Medical Center (August 2009 to May 2010). The taxonomic profile of the urinary microbiome was characterized by high-throughput sequencing of the V4 region of the microbial 16S rRNA gene. Associations between the microbial composition of taxa relative abundance and GDM were evaluated using multivariable logistic regression while controlling for maternal characteristics. Relative abundance (%) was categorized as absent, ≤median or median values. Alpha diversity (richness and evenness) and beta diversity (community structure) were also compared between cases and controls. RESULTS:A total of 27 microbial genera were identified in the cases and controls, which were predominated by the genera Lactobacillus and Gardnerella. The odds of a relative abundance median was decreased for the genus Aerococcus while it was increased for the genus Veillonella among the cases compared to the controls in the crude model. After adjusting for age and race, GDM cases had a decreased odds of higher relative abundance (median vs. absence) of Aerococcus compared to the controls, with the upper bound of the confidence interval (CI) marginally crossing 1.0 (adjusted odds ratio: 0.45, 95% CI 0.18, 1.10). No difference was observed in alpha and beta diversity metrics between cases and controls. CONCLUSIONS:Our hypothesis-generating results suggest the urinary microbiome composition may differ by GDM status. KEYWORDS: Microbiome, Pregnancy outcomes, Molecular epidemiology

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,061
Score d'incertitude au seuil0,682

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,033
Tête enseignante GPT0,293
Écart entre enseignants0,260 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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