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Enregistrement W3197264332 · doi:10.1136/jclinpath-2021-207906

Gene of the month: <i>STK11</i>

2021· review· en· W3197264332 sur OpenAlexaff
Roman Zyla, Elan Hahn, Anjelica Hodgson

Notice bibliographique

RevueJournal of Clinical Pathology · 2021
Typereview
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueGenetic factors in colorectal cancer
Établissements canadiensToronto General HospitalUniversity Health NetworkUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésSTK11Cancer researchBiologyKinaseGermline mutationCancerProtein kinase AMutationMedicineImmunologyGeneGeneticsKRAS

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

STK11 encodes for the protein liver kinase B1, a serine/threonine kinase which is involved in a number of physiological processes including regulation of cellular metabolism, cell polarity and the DNA damage response. It acts as a tumour suppressor via multiple mechanisms, most classically through AMP-activated protein kinase-mediated inhibition of the mammalian target of rapamycin signalling pathway. Germline loss-of-function mutations in STK11 give rise to Peutz-Jeghers syndrome, which is associated with hamartomatous polyps of the gastrointestinal tract, mucocutaneous pigmentation and a substantially increased lifetime risk of many cancers. In the sporadic setting, STK11 mutations are commonly seen in a subset of adenocarcinomas of the lung in addition to a number of other tumours occurring at various sites. Mutations in STK11 have been associated with worse prognoses across a range of malignancies and may be a predictor of poor response to immunotherapy in a subset of lung cancers, though further studies are needed before the presence of STK11 mutations can be implemented as a routine clinical biomarker.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,006
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Autre devis · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,988
Score d'incertitude au seuil0,948

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,006
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0050,003
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,204
Tête enseignante GPT0,493
Écart entre enseignants0,289 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeAutre devis
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations21
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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