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Enregistrement W3197709450

Identification of Maize Aquaporin Gene ZmPIP4c as a Signature of C4 Traits

2020· article· en· W3197709450 sur OpenAlexvenueno aff
Xiang Li, Yuling Liang, Zhiying Ma, Zheng Liu

Notice bibliographique

RevueMaize Genomics and Genetics · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant nutrient uptake and metabolism
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPhosphoenolpyruvate carboxylaseVascular bundleAquaporinGene expressionGenePhotosynthesisBiologyC4 photosynthesisCrassulacean acid metabolismRuBisCOBiochemistryWater transportBotanyRegulation of gene expressionPlant physiologyNAD+ kinaseCell biologyEnzymeWater flow
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

As a water transmembrane transporter, aquaporin can not only transport water in plants, but also transport small molecules such as CO 2 and H 2 O 2 , thus affecting physiological processes such as photosynthesis and so on. Although photosynthesis is critical to plant growth, the photosynthetic mechanisms of C 3 plants are different from that of C 4 plants as compared with C 3 leaves, C 4 leaves have typical Kranz structure and possess larger and well-developed bundle sheath cells which is favorable for water storage. We therefore performed bioinformatic and gene expression analyses on C 4 maize aquaporin, and identified a gene called ZmPIP4c which shows high specific expression in bundle sheath cells in leaves. thus is conducive to water transport into sheath cells and to balance the water supply in mesophyll cells. Further expression analysis on the ZmPIP4c along leaf gradient revealed that the expression trend of this gene was not only consistent with that of C 4 marker gene - NAD-malic enzyme gene ( NAD-ME ), a gene usually used to screen C 4 photosynthesis related transcripts, but also consistent with other C 4 genes such as phosphoenolpyruvate carboxylase gene ( PEPC ) and carbonic anhydrase gene ( CA ). The expressions of these genes all showed gradual increase from leaf base to leaf tip, suggesting that ZmPIP4c is a signature of C 4 traits. In addition, ZmPIP4c , NAD-ME , PEPC and CA also showed similar expression trends under the regulation of circadian rhythm, indicating that ZmPIP4c can provide optimal water environment for the efficient operation of C 4 cycle in bundle sheath cells under light, and avoid energy and water waste under dark. Moreover, the expressions of ZmPIP4c gene and of mesophyll-specifically-expressed genes, PEPC and CA , were all down-regulated under salt stress. As there exists water conduction signal between bundle sheath cells and mesophyll cells, down-regulation of ZmPIP4c gene may change the inner water solution environment within mesophyll cells, thereafter affecting the expresions of PEPC and CA genes. In brief, our study on ZmPIP4c gene of maize provides us a signature gene to study new C 4 traits that have not been reported yet, and helps us to understand the molecular mechanism how the cell-specific aquaporin gene mediates the C 4 cycle.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,225
Score d'incertitude au seuil0,212

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,196
Écart entre enseignants0,180 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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