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Enregistrement W3197792981 · doi:10.1038/s41598-021-97140-7

HLA-DRB1 and HLA-DQB1 genetic diversity modulates response to lithium in bipolar affective disorders

2021· article· en· W3197792981 sur OpenAlexafffund
Sigrid Le Clerc, Laura Lombardi, Bernhard T. Baune, Azmeraw T. Amare, Klaus Oliver Schubert, Liping Hou, Scott R. Clark, Sergi Papiol, Micah Cearns, Urs Heilbronner, Franziska Degenhardt, Fasil Tekola‐Ayele, Yi-Hsiang Hsu, Tatyana Shekhtman, Mazda Adli, Nirmala Akula, Kazufumi Akiyama, Raffaella Ardau, Bárbara Arias, Jean-Michel Aubry, Lena Backlund, Abesh Kumar Bhattacharjee, Frank Bellivier, Antonio Benabarre, Susanne Bengesser, Joanna M. Biernacka, Armin Birner, Clara Brichant‐Petitjean, Pablo Cervantes, Hsi‐Chung Chen, Caterina Chillotti, Sven Cichon, Cristiana Cruceanu, Piotr M. Czerski, Nina Dalkner, Alexandre Dayer, Maria Del Zompo, J. Raymond DePaulo, Bruno Étain, Stéphane Jamain, Peter Falkai, Andreas J. Forstner, Louise Frisén, Mark A. Frye, Janice M. Fullerton, Sébastien Gard, Julie Garnham, Fernando S. Goes, Maria Grigoroiu‐Serbânescu, Paul Grof, Ryota Hashimoto, Joanna Hauser, Stefan Herms, Per Hoffmann, Esther Jiménez, Jean‐Pierre Kahn, Layla Kassem, Po‐Hsiu Kuo, Tadafumi Kato, John R. Kelsoe, Sarah Kittel‐Schneider, Ewa Ferensztajn‐Rochowiak, Barbara König, Ichiro Kusumi, Gonzalo Laje, Mikael Landén, Catharina Lavebratt, Susan G. Leckband, Alfonso Tortorella, Mirko Manchia, Lina Martinsson, Michael J. McCarthy, Susan L. McElroy, Francesc Colom, Vincent Millischer, Marina Mitjans, Francis M. Mondimore, Palmiero Monteleone, Caroline M. Nievergelt, Markus M. Nöthen, Tomáš Novák, Claire O’Donovan, Norio Ozaki, Urban Ösby, Andrea Pfennig, James B. Potash, Andreas Reif, Eva Z. Reininghaus, Guy A. Rouleau, Janusz Rybakowski, Martin Schalling, Peter R. Schofield, Barbara Schweizer, Giovanni Severino, Paul D. Shilling, Katzutaka Shimoda, Christian Simhandl, Claire Slaney, Claudia Pisanu, Alessio Squassina, Thomas Stamm, Pavla Stopková, Mario Maj, Gustavo Turecki, Eduard Vieta, Julia Veeh, Stephanie H. Witt, A. Jordan Wright, Peter P. Zandi, Philip B. Mitchell, Michael Bauer, Martin Alda, Marcella Rietschel, Francis J. McMahon, Thomas G. Schulze, Jean-Louis Spadoni, Wahid Boukouaci, Jean‐Romain Richard, Philippe Le Corvoisier, Caroline Barrau, Jean-François Zagury, Marion Leboyer, Ryad Tamouza

Notice bibliographique

RevueScientific Reports · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueBipolar Disorder and Treatment
Établissements canadiensMcGill UniversityDouglas Mental Health University InstituteMcGill University Health CentreDalhousie UniversityMontreal Neurological Institute and Hospital
Organismes subventionnairesNational Cancer InstituteNational Health and Medical Research CouncilCanadian Institutes of Health ResearchNational Institutes of HealthUnitatea Executiva pentru Finantarea Invatamantului Superior, a Cercetarii, Dezvoltarii si InovariiMinistry of Education, IndiaVirginia Commonwealth UniversityVetenskapsrådetNational Institute of Mental HealthStockholms Läns LandstingFondation pour la Recherche MédicaleMinisterstvo Školství, Mládeže a TělovýchovyBundesministerium für Bildung und ForschungGrantová Agentura České RepublikyCentro de Investigación Biomédica en Red de Salud MentalKarolinska InstitutetInstitut National de la Santé et de la Recherche MédicaleAgence Nationale de la RechercheUniversity of OxfordU.S. Department of Veterans AffairsUniversity of New South WalesSchweizerischer Nationalfonds zur Förderung der Wissenschaftlichen ForschungFondation FondaMentalDeutsche ForschungsgemeinschaftUniversity of LouisvilleBroad InstituteJohns Hopkins UniversityNational Institute on Drug AbuseStanley Center for Psychiatric Research, Broad InstituteUniversity of PennsylvaniaRush UniversityWayne State UniversityNational Science Foundation
Mots-clésHuman leukocyte antigenBipolar disorderImmunologyAlleleMedicineGeneticsLithium (medication)BiologyPsychiatryAntigenGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Bipolar affective disorder (BD) is a severe psychiatric illness, for which lithium (Li) is the gold standard for acute and maintenance therapies. The therapeutic response to Li in BD is heterogeneous and reliable biomarkers allowing patients stratification are still needed. A GWAS performed by the International Consortium on Lithium Genetics (ConLiGen) has recently identified genetic markers associated with treatment responses to Li in the human leukocyte antigens (HLA) region. To better understand the molecular mechanisms underlying this association, we have genetically imputed the classical alleles of the HLA region in the European patients of the ConLiGen cohort. We found our best signal for amino-acid variants belonging to the HLA-DRB1*11:01 classical allele, associated with a better response to Li (p < 1 × 10−3; FDR < 0.09 in the recessive model). Alanine or Leucine at position 74 of the HLA-DRB1 heavy chain was associated with a good response while Arginine or Glutamic acid with a poor response. As these variants have been implicated in common inflammatory/autoimmune processes, our findings strongly suggest that HLA-mediated low inflammatory background may contribute to the efficient response to Li in BD patients, while an inflammatory status overriding Li anti-inflammatory properties would favor a weak response.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,013

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,242
Écart entre enseignants0,233 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations25
Publié2021
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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