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Enregistrement W3198441495 · doi:10.1186/s40035-021-00259-w

Predictability of polygenic risk score for progression to dementia and its interaction with APOE ε4 in mild cognitive impairment

2021· article· en· W3198441495 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.
no affAucune affiliation canadienne : ce travail est invisible pour une base fondée sur la seule affiliation.
Aucune affiliation canadienne. Une base fondée sur la seule affiliation (le devis habituel) n'aurait jamais vu ce travail. C'est l'un des travaux qui justifient l'inversion de la base.

Notice bibliographique

RevueTranslational Neurodegeneration · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic Associations and Epidemiology
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Institute on AgingNational Institute of Biomedical Imaging and BioengineeringCanadian Institutes of Health ResearchNational Institutes of HealthU.S. National Library of MedicineIXICOH. Lundbeck A/SServierEisaiMeso Scale DiagnosticsNational Research Foundation of KoreaNational Research FoundationNorthern California Institute for Research and EducationF. Hoffmann-La RochePfizerBioClinicaBiogenMinistry of Science and ICT, South KoreaSeoul National UniversityGenentechSeoul National University Bundang HospitalEli Lilly and CompanyU.S. Department of DefenseAlzheimer's Disease Neuroimaging InitiativeNovartis Pharmaceuticals CorporationBristol-Myers SquibbAlzheimer's AssociationFoundation for the National Institutes of Health
Mots-clésApolipoprotein EInternal medicineHazard ratioDementiaMedicineAlzheimer's Disease Neuroimaging InitiativeProportional hazards modelOncologyNeurologyDiseaseConfidence intervalPsychiatry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Background The combinatorial effect of multiple genetic factors calculated as a polygenic risk score (PRS) has been studied to predict disease progression to Alzheimer’s disease (AD) from mild cognitive impairment (MCI). Previous studies have investigated the performance of PRS in the prediction of disease progression to AD by including and excluding single nucleotide polymorphisms within the region surrounding the APOE gene. These studies may have missed the APOE genotype-specific predictability of PRS for disease progression to AD. Methods We analyzed 732 MCI from the Alzheimer’s Disease Neuroimaging Initiative cohort, including those who progressed to AD within 5 years post-baseline ( n = 270) and remained stable as MCI ( n = 462). The predictability of PRS including and excluding the APOE region (PRS + APOE and PRS − APOE ) on the conversion to AD and its interaction with the APOE ε4 carrier status were assessed using Cox regression analyses. Results PRS + APOE (hazard ratio [HR] 1.468, 95% CI 1.335–1.615) and PRS − APOE (HR 1.293, 95% CI 1.157–1.445) were both associated with a significantly increased risk of MCI progression to dementia. The interaction between PRS + APOE and APOE ε4 carrier status was significant with a P -value of 0.0378. The association of PRSs with the progression risk was stronger in APOE ε4 non-carriers (PRS + APOE : HR 1.710, 95% CI 1.244–2.351; PRS − APOE : HR 1.429, 95% CI 1.182–1.728) than in APOE ε4 carriers (PRS + APOE : HR 1.167, 95% CI 1.005–1.355; PRS − APOE : HR 1.172, 95% CI 1.020–1.346). Conclusions PRS could predict the conversion of MCI to dementia with a stronger association in APOE ε4 non-carriers than APOE ε4 carriers. This indicates PRS as a potential genetic predictor particularly for MCI with no APOE ε4 alleles.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,095
Score d'incertitude au seuil0,322

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,296
Écart entre enseignants0,277 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle