Induction of transposable element expression is central to innate sensing
Notice bibliographique
Résumé
SUMMARY Evidence indicates that transposable elements (TEs) stimulate innate sensing pathways in various pathologies but it is not clear whether they are sensed during normal physiological responses. Here we show that, during activation with an exogenous pathogen associated molecular pattern (PAMP), dendritic cells (DCs) epigenetically remodel heterochromatin at TEs by depleting the methyltransferase Suv39h1 and reducing histone-3 lysine-9 trimethylation (H3K9me3). TLR4 signaling activates TE expression to enhance innate responses through the DNA sensor cGAS. Cytosolic cGAS-bound DNA comprised LINE1 TEs as the predominant endogenous ligands. Concordantly, LINE1 inhibition attenuated the type-I IFN response to LPS and rescued influenza virus infection. We propose that in healthy cells, exogenous PAMPs epigenetically activate self-derived PAMPs (LINE1) that engage cGAS to enhance responses. These data explain why pathogens employ redundant and broad innate immune countermeasures, to suppress activation of host PAMPs and illustrate a hitherto unappreciated role for host genome-derived PAMPs in response to pathogens.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».